Run ID: SRR5818686
Sample name:
Date: 04-04-2023 11:42:41
Number of reads: 1745969
Percentage reads mapped: 94.85
Strain: lineage4.2.2.2
Drug-resistance: Sensitive
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.2 | Euro-American | H;T;LAM | None | 1.0 |
lineage4.2.2 | Euro-American (Ural) | T;LAM7-TUR | None | 1.0 |
lineage4.2.2.2 | Euro-American (Ural) | T;LAM7-TUR | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
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