Run ID: ERR4821154
Sample name:
Date: 01-04-2023 17:05:34
Number of reads: 963277
Percentage reads mapped: 90.56
Strain: lineage2.2.1
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage2 | East-Asian | Beijing | RD105 | 1.0 |
lineage2.2 | East-Asian (Beijing) | Beijing-RD207 | RD105;RD207 | 1.0 |
lineage2.2.1 | East-Asian (Beijing) | Beijing-RD181 | RD105;RD207;RD181 | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 | streptomycin |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrA | 7362 | p.Glu21Gln | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 9304 | p.Gly668Asp | missense_variant | 1.0 |
fgd1 | 491742 | c.960T>C | synonymous_variant | 1.0 |
mshA | 575907 | p.Ala187Val | missense_variant | 1.0 |
ccsA | 620625 | p.Ile245Met | missense_variant | 0.97 |
rpoC | 763031 | c.-339T>C | upstream_gene_variant | 1.0 |
rpoC | 763648 | c.279C>G | synonymous_variant | 0.1 |
rpoC | 763660 | c.291T>C | synonymous_variant | 0.1 |
rpoC | 763666 | c.297G>C | synonymous_variant | 0.1 |
rpoC | 764611 | c.1242G>T | synonymous_variant | 0.12 |
mmpL5 | 775639 | p.Ile948Val | missense_variant | 1.0 |
mmpL5 | 776100 | p.Thr794Ile | missense_variant | 1.0 |
mmpL5 | 776182 | p.Asp767Asn | missense_variant | 1.0 |
mmpL5 | 777414 | p.Ala356Val | missense_variant | 0.12 |
mmpS5 | 779615 | c.-710C>G | upstream_gene_variant | 1.0 |
rpsL | 781395 | c.-165T>C | upstream_gene_variant | 1.0 |
Rv1258c | 1406760 | c.580_581insC | frameshift_variant | 1.0 |
rrs | 1471659 | n.-187C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
rrs | 1471929 | n.84C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.13 |
rrs | 1471931 | n.86G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrs | 1471932 | n.87A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrs | 1471934 | n.89A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrs | 1471979 | n.134T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrs | 1471985 | n.140T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1471986 | n.141C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1472102 | n.257G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1472106 | n.261G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1472108 | n.263C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrs | 1472112 | n.267C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrs | 1472113 | n.268T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472122 | n.277G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrs | 1472123 | n.278A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrs | 1472124 | n.279C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrs | 1472150 | n.305T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrs | 1472151 | n.306C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.13 |
rrs | 1472155 | n.310C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472160 | n.315C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.26 |
rrs | 1472172 | n.327T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1472225 | n.380C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrs | 1472251 | n.406G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrs | 1472258 | n.413A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472259 | n.414C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrs | 1472471 | n.626G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472484 | n.639_640insC | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472494 | n.649A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472498 | n.653C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472504 | n.659A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrs | 1472505 | n.660G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472507 | n.662C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472517 | n.672T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrs | 1472518 | n.673G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrs | 1472530 | n.685G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrs | 1472537 | n.692C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrs | 1472558 | n.713G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.1 |
rrs | 1472566 | n.721G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrs | 1472571 | n.726G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrs | 1472579 | n.734G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472580 | n.735C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472581 | n.736A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrs | 1472584 | n.739A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1472598 | n.753A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrs | 1472599 | n.754G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrs | 1472616 | n.771G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1472647 | n.802C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1472655 | n.810G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1472655 | n.810G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrs | 1472658 | n.813G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1472660 | n.815T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.37 |
rrs | 1472661 | n.816A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.53 |
rrs | 1472686 | n.841G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472687 | n.843dupT | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1472687 | n.842A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrs | 1472690 | n.845C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrs | 1472692 | n.847T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrs | 1472697 | n.852T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.37 |
rrs | 1472707 | n.862A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1472713 | n.868T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472714 | n.869A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 |
rrs | 1472716 | n.871C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrs | 1472742 | n.897C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472744 | n.899A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472781 | n.936C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrs | 1472790 | n.945T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472793 | n.948A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1472803 | n.958T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1472824 | n.979T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrs | 1472825 | n.980G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472828 | n.983T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrs | 1472895 | n.1050C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrs | 1472952 | n.1107T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1472954 | n.1109T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1472955 | n.1110C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1472956 | n.1111T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrs | 1472957 | n.1112C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrs | 1472973 | n.1128A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrs | 1472973 | n.1128A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrs | 1472974 | n.1129A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrs | 1472987 | n.1142G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 |
rrs | 1472988 | n.1143T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.12 |
rrs | 1472989 | n.1144G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.28 |
rrs | 1472990 | n.1145A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrs | 1472993 | n.1148G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrs | 1473035 | n.1190G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrs | 1473047 | n.1202C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1473052 | n.1207G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.12 |
rrs | 1473053 | n.1208T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrs | 1473055 | n.1210C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrs | 1473056 | n.1211A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrs | 1473066 | n.1221A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1473080 | n.1235C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1473081 | n.1236C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrs | 1473088 | n.1243A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473093 | n.1248C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrs | 1473100 | n.1255G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473101 | n.1256C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrs | 1473102 | n.1257C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.53 |
rrs | 1473104 | n.1259C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473110 | n.1265T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473111 | n.1266A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473115 | n.1270G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrs | 1473121 | n.1276T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473123 | n.1278A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1473130 | n.1285G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.26 |
rrs | 1473132 | n.1287T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.12 |
rrs | 1473145 | n.1300C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrs | 1473148 | n.1303G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.26 |
rrs | 1473163 | n.1318C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrs | 1473166 | n.1321G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrs | 1473172 | n.1327T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1473173 | n.1328C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrs | 1473177 | n.1332G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrs | 1473192 | n.1347A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1473199 | n.1356delA | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1473205 | n.1360T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrs | 1473221 | n.1376C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1473252 | n.1407T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrs | 1473259 | n.1414C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrs | 1473276 | n.1431A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1473277 | n.1432G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.37 |
rrs | 1473288 | n.1443C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrs | 1473301 | n.1456T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1473316 | n.1471C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.59 |
rrs | 1473319 | n.1474C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.11 |
rrl | 1473384 | n.-274A>G | upstream_gene_variant | 0.43 |
rrl | 1473475 | n.-183G>C | upstream_gene_variant | 0.17 |
rrl | 1474218 | n.561T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474249 | n.592G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474253 | n.596A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474269 | n.612C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474282 | n.625G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474287 | n.630T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474289 | n.632C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474290 | n.633T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474293 | n.637_649delCCTCTCCGGAGGA | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474308 | n.651G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474310 | n.653T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474315 | n.658A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474351 | n.694G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474353 | n.696A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474362 | n.705A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474467 | n.810A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474487 | n.830G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474496 | n.839C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474497 | n.840G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474503 | n.846G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474506 | n.849C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474507 | n.850G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474508 | n.851C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474516 | n.859C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1474517 | n.860C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1474527 | n.870T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1474537 | n.880G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474542 | n.885A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1474626 | n.969T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1474632 | n.975G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1474634 | n.977T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1474636 | n.979A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1474637 | n.980C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1474638 | n.981C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1474643 | n.986A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1474658 | n.1001A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1474663 | n.1006C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474666 | n.1009T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1474672 | n.1015C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474676 | n.1019T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474677 | n.1020A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474687 | n.1030C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1474717 | n.1060A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1474734 | n.1077G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1474749 | n.1092C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrl | 1474760 | n.1103A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474774 | n.1117A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrl | 1474784 | n.1127C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1474794 | n.1137C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1474798 | n.1141C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1474806 | n.1149A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1474812 | n.1155G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrl | 1474819 | n.1162T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrl | 1474823 | n.1166C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1474824 | n.1167A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrl | 1474825 | n.1168G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1474830 | n.1173A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1474831 | n.1174A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1474832 | n.1175A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrl | 1474837 | n.1180A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1474864 | n.1207C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1475722 | n.2065G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1475751 | n.2094C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1475752 | n.2095C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrl | 1475753 | n.2096C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1475758 | n.2101A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1475769 | n.2112T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1475775 | n.2118G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1475777 | n.2120A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1475869 | n.2212C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1475881 | n.2224T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1475883 | n.2226A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1475883 | n.2226A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1475884 | n.2227A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1475896 | n.2239A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1475897 | n.2240T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrl | 1475898 | n.2241A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1475899 | n.2242G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1475900 | n.2243A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrl | 1475902 | n.2245T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1475906 | n.2249C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1475916 | n.2259C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1475937 | n.2280A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1475943 | n.2286G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1475945 | n.2288C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1475952 | n.2295A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1475970 | n.2313C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 |
rrl | 1475975 | n.2318C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1475977 | n.2320A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1475988 | n.2331A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476357 | n.2700T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476359 | n.2702C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1476369 | n.2712C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.1 |
rrl | 1476381 | n.2724G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.66 |
rrl | 1476428 | n.2771C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrl | 1476429 | n.2772A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1476466 | n.2809C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrl | 1476481 | n.2824T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrl | 1476506 | n.2849T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.53 |
rrl | 1476513 | n.2856G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1476515 | n.2858C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1476523 | n.2866T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476524 | n.2867C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476525 | n.2868A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476536 | n.2879G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1476538 | n.2881A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1476539 | n.2882A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1476598 | n.2941C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rpsA | 1833410 | c.-132G>A | upstream_gene_variant | 1.0 |
rpsA | 1834177 | c.636A>C | synonymous_variant | 1.0 |
tlyA | 1917972 | c.33A>G | synonymous_variant | 1.0 |
katG | 2154724 | p.Arg463Leu | missense_variant | 1.0 |
PPE35 | 2167926 | p.Leu896Ser | missense_variant | 1.0 |
PPE35 | 2170357 | p.Ala86Thr | missense_variant | 0.14 |
PPE35 | 2170371 | p.Thr81Val | missense_variant | 0.15 |
PPE35 | 2170385 | c.228G>T | synonymous_variant | 0.15 |
PPE35 | 2170392 | p.Gly74Ala | missense_variant | 0.14 |
PPE35 | 2170400 | c.213G>C | synonymous_variant | 0.1 |
Rv1979c | 2223293 | c.-129A>G | upstream_gene_variant | 1.0 |
ahpC | 2726350 | p.Trp53Leu | missense_variant | 0.21 |
folC | 2747795 | c.-197G>T | upstream_gene_variant | 0.11 |
thyA | 3074096 | p.Arg126Trp | missense_variant | 0.11 |
ald | 3086788 | c.-32T>C | upstream_gene_variant | 1.0 |
Rv3083 | 3448702 | p.Arg67Ser | missense_variant | 0.13 |
Rv3083 | 3449214 | c.711C>T | synonymous_variant | 0.12 |
fprA | 3473996 | c.-11_-10insA | upstream_gene_variant | 1.0 |
Rv3236c | 3612813 | p.Thr102Ala | missense_variant | 1.0 |
embA | 4242643 | c.-590C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
embA | 4243460 | c.228C>T | synonymous_variant | 0.97 |
embA | 4244836 | p.Leu535Pro | missense_variant | 0.13 |
aftB | 4267647 | p.Asp397Gly | missense_variant | 1.0 |
whiB6 | 4338595 | c.-75delG | upstream_gene_variant | 1.0 |
gid | 4407588 | c.615A>G | synonymous_variant | 1.0 |
gid | 4407927 | p.Glu92Asp | missense_variant | 1.0 |