Run ID: ERR2513450
Sample name:
Date: 31-03-2023 19:41:11
Number of reads: 1746185
Percentage reads mapped: 94.4
Strain: lineage1.2.1.2.1
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage1 | Indo-Oceanic | EAI | RD239 | 1.0 |
lineage1.2.1 | Indo-Oceanic | EAI2 | RD239 | 1.0 |
lineage1.2.1.2 | Indo-Oceanic | NA | RD239 | 1.0 |
lineage1.2.1.2.1 | Indo-Oceanic | NA | RD239 | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 | streptomycin |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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