Run ID: ERR2514801
Sample name:
Date: 31-03-2023 20:34:13
Number of reads: 2735190
Percentage reads mapped: 92.69
Strain: lineage1.1.3.2
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage1 | Indo-Oceanic | EAI | RD239 | 1.0 |
lineage1.1 | Indo-Oceanic | EAI3;EAI4;EAI5;EAI6 | RD239 | 1.0 |
lineage1.1.3 | Indo-Oceanic | EAI6 | RD239 | 1.0 |
lineage1.1.3.2 | Indo-Oceanic | NA | RD239 | 0.99 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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