Run ID: ERR4820369
Sample name:
Date: 01-04-2023 16:38:33
Number of reads: 430366
Percentage reads mapped: 83.18
Strain: lineage2.2.1
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage2 | East-Asian | Beijing | RD105 | 0.98 |
lineage2.2 | East-Asian (Beijing) | Beijing-RD207 | RD105;RD207 | 0.99 |
lineage2.2.1 | East-Asian (Beijing) | Beijing-RD181 | RD105;RD207;RD181 | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
rrs | 1472644 | n.799C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 | streptomycin |
rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 | streptomycin |
rrs | 1473247 | n.1402C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 | kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin |
rrs | 1473329 | n.1484G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 | kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin |
gid | 4408100 | c.102delG | frameshift_variant | 1.0 | streptomycin |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrA | 7362 | p.Glu21Gln | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 9304 | p.Gly668Asp | missense_variant | 1.0 |
fgd1 | 491742 | c.960T>C | synonymous_variant | 1.0 |
ccsA | 620625 | p.Ile245Met | missense_variant | 1.0 |
rpoC | 763031 | c.-339T>C | upstream_gene_variant | 0.91 |
rpoC | 763622 | p.Ala85Ser | missense_variant | 0.17 |
mmpL5 | 775639 | p.Ile948Val | missense_variant | 1.0 |
mmpL5 | 775790 | c.2691C>G | synonymous_variant | 0.13 |
mmpL5 | 776100 | p.Thr794Ile | missense_variant | 1.0 |
mmpS5 | 779615 | c.-710C>G | upstream_gene_variant | 1.0 |
rpsL | 781395 | c.-165T>C | upstream_gene_variant | 1.0 |
fbiC | 1303325 | p.Ala132Val | missense_variant | 0.11 |
Rv1258c | 1406760 | c.580_581insC | frameshift_variant | 1.0 |
rrs | 1471659 | n.-187C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
rrs | 1472075 | n.230A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472108 | n.263C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrs | 1472112 | n.267C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472123 | n.278A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472124 | n.279C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrs | 1472148 | n.303T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1472150 | n.305T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrs | 1472152 | n.307C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1472155 | n.310C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1472172 | n.327T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472507 | n.662C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472513 | n.668T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472517 | n.672T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrs | 1472518 | n.673G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrs | 1472530 | n.685G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472537 | n.692C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472544 | n.699C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472545 | n.700A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472549 | n.704G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1472558 | n.713G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 |
rrs | 1472566 | n.721G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472569 | n.724G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 |
rrs | 1472571 | n.726G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472579 | n.734G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472580 | n.735C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.46 |
rrs | 1472581 | n.736A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrs | 1472597 | n.752G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrs | 1472598 | n.753A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472599 | n.754G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472607 | n.762G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 |
rrs | 1472616 | n.771G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrs | 1472655 | n.810G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrs | 1472655 | n.810G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472658 | n.813G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrs | 1472660 | n.815T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1472661 | n.816A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrs | 1472687 | n.842A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472689 | n.844C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472690 | n.845C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472692 | n.847T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472697 | n.852T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472713 | n.868T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrs | 1472714 | n.869A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472716 | n.871C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrs | 1472742 | n.897C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472744 | n.899A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472755 | n.910G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1472781 | n.936C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472790 | n.945T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472793 | n.948A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472803 | n.958T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrs | 1472895 | n.1050C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrs | 1472952 | n.1107T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrs | 1472953 | n.1108G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.12 |
rrs | 1472955 | n.1110C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrs | 1472956 | n.1111T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrs | 1472957 | n.1112C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1472958 | n.1113A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472973 | n.1128A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrs | 1472974 | n.1129A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472987 | n.1142G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1472988 | n.1143T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1472989 | n.1144G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472990 | n.1145A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrs | 1473035 | n.1190G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473055 | n.1210C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrs | 1473056 | n.1211A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrs | 1473066 | n.1221A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1473088 | n.1243A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrs | 1473093 | n.1248C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1473100 | n.1255G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473102 | n.1257C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1473104 | n.1259C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473110 | n.1265T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrs | 1473111 | n.1266A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473115 | n.1270G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1473121 | n.1276T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1473123 | n.1278A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrs | 1473130 | n.1285G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrs | 1473145 | n.1300C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrs | 1473148 | n.1303G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1473163 | n.1318C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrs | 1473166 | n.1321G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1473172 | n.1327T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.11 |
rrs | 1473173 | n.1328C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrs | 1473177 | n.1332G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.12 |
rrs | 1473192 | n.1347A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.12 |
rrs | 1473205 | n.1360T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1473221 | n.1376C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1473226 | n.1381C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1473248 | n.1403G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1473249 | n.1404T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1473252 | n.1407T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1473255 | n.1410A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1473259 | n.1414C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1473260 | n.1415G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1473262 | n.1417T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1473276 | n.1431A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrs | 1473276 | n.1431A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1473283 | n.1438T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1473284 | n.1439A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1473301 | n.1456T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1473301 | n.1456T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1473314 | n.1469A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1473315 | n.1470T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrs | 1473316 | n.1471C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrs | 1473318 | n.1473G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1473319 | n.1474C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrs | 1473324 | n.1479G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1473327 | n.1482A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1473328 | n.1483C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1473352 | n.1507C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1474351 | n.694G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474353 | n.696A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474355 | n.698A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474362 | n.705A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474387 | n.730C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474393 | n.736A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474402 | n.745T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474409 | n.756_776delACCCACACGCGCATACGCGCG | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474435 | n.778G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1474437 | n.781_782delAA | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474448 | n.791T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1474467 | n.810A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1474488 | n.831G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1474495 | n.838G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474498 | n.841G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474505 | n.848C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1474508 | n.851C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1474516 | n.859C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1474527 | n.870T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1474537 | n.880G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474542 | n.885A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474626 | n.969T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474632 | n.975G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474634 | n.977T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474636 | n.979A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474638 | n.981C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474658 | n.1001A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474663 | n.1006C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474673 | n.1016T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474676 | n.1019T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474677 | n.1020A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1474692 | n.1035G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474734 | n.1077G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474760 | n.1103A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474794 | n.1137C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474824 | n.1167A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474830 | n.1173A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474831 | n.1174A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474864 | n.1207C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474903 | n.1246T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475026 | n.1369G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475031 | n.1374G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475059 | n.1403_1404insTA | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475062 | n.1405A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475065 | n.1409_1411delCAA | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475080 | n.1425_1426delCC | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475090 | n.1433A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475104 | n.1447T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475114 | n.1457C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475124 | n.1467A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475703 | n.2046A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1475751 | n.2094C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1475754 | n.2097G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1475756 | n.2099T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1475761 | n.2104C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1475762 | n.2105G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1475763 | n.2107_2108delAA | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1475774 | n.2117C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1475775 | n.2118G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1475777 | n.2120A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1475869 | n.2212C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475898 | n.2241A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1475899 | n.2242G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1476164 | n.2507A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 |
rrl | 1476179 | n.2522C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476194 | n.2537A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1476200 | n.2543A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1476201 | n.2544C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476207 | n.2550T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476214 | n.2557G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1476215 | n.2558C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1476221 | n.2564T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476224 | n.2567A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 |
rrl | 1476245 | n.2588C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476251 | n.2594T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476252 | n.2595T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476260 | n.2603A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476359 | n.2702C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrl | 1476381 | n.2724G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1476428 | n.2771C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrl | 1476429 | n.2772A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrl | 1476466 | n.2809C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1476481 | n.2824T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476506 | n.2849T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrl | 1476513 | n.2856G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1476515 | n.2858C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrl | 1476523 | n.2866T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrl | 1476524 | n.2867C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1476525 | n.2868A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1476528 | n.2871A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrl | 1476536 | n.2879G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1476538 | n.2881A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1476539 | n.2882A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1476584 | n.2927C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1476585 | n.2928A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1476600 | n.2943A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1476608 | n.2951C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1476614 | n.2957A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1476616 | n.2959A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1476619 | n.2962C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
inhA | 1674930 | p.Cys243Trp | missense_variant | 0.17 |
rpsA | 1833979 | c.438T>G | synonymous_variant | 0.21 |
rpsA | 1834000 | c.459G>C | synonymous_variant | 0.14 |
rpsA | 1834012 | c.471G>C | synonymous_variant | 0.16 |
rpsA | 1834015 | c.474G>C | synonymous_variant | 0.16 |
rpsA | 1834024 | c.483G>C | synonymous_variant | 0.19 |
rpsA | 1834034 | p.Ile165Val | missense_variant | 0.2 |
rpsA | 1834041 | p.Lys167Met | missense_variant | 0.18 |
rpsA | 1834045 | c.504G>A | synonymous_variant | 0.18 |
rpsA | 1834046 | p.Ile169Leu | missense_variant | 0.18 |
rpsA | 1834066 | c.525G>A | synonymous_variant | 0.14 |
rpsA | 1834099 | c.558C>G | synonymous_variant | 0.22 |
rpsA | 1834177 | c.636A>C | synonymous_variant | 0.94 |
tlyA | 1917972 | c.33A>G | synonymous_variant | 1.0 |
katG | 2154300 | c.1812G>A | synonymous_variant | 0.12 |
katG | 2154724 | p.Arg463Leu | missense_variant | 1.0 |
PPE35 | 2167926 | p.Leu896Ser | missense_variant | 1.0 |
PPE35 | 2170048 | p.Leu189Val | missense_variant | 0.22 |
PPE35 | 2170053 | p.Thr187Ser | missense_variant | 0.2 |
Rv1979c | 2223293 | c.-129A>G | upstream_gene_variant | 1.0 |
ahpC | 2726338 | p.Val49Gly | missense_variant | 0.33 |
ahpC | 2726341 | p.Val50Gly | missense_variant | 0.33 |
Rv2752c | 3065129 | c.1063C>T | synonymous_variant | 1.0 |
ald | 3086788 | c.-32T>C | upstream_gene_variant | 1.0 |
fprA | 3473996 | c.-11_-10insA | upstream_gene_variant | 1.0 |
fprA | 3474734 | p.Lys243Arg | missense_variant | 0.11 |
Rv3236c | 3612037 | p.Phe360Leu | missense_variant | 1.0 |
Rv3236c | 3612413 | p.Ser235Leu | missense_variant | 1.0 |
Rv3236c | 3612813 | p.Thr102Ala | missense_variant | 0.8 |
fbiA | 3641158 | p.Ala206Thr | missense_variant | 0.92 |
clpC1 | 4039484 | c.1221T>G | synonymous_variant | 0.33 |
embC | 4242354 | p.Gly831Glu | missense_variant | 0.18 |
embA | 4242643 | c.-590C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
embA | 4243460 | c.228C>T | synonymous_variant | 1.0 |
embA | 4244633 | c.1401C>T | synonymous_variant | 0.18 |
aftB | 4267647 | p.Asp397Gly | missense_variant | 1.0 |
ethA | 4326676 | p.Ser266Arg | missense_variant | 0.96 |
whiB6 | 4338595 | c.-75delG | upstream_gene_variant | 1.0 |
gid | 4407588 | c.615A>G | synonymous_variant | 1.0 |
gid | 4407927 | p.Glu92Asp | missense_variant | 1.0 |