Run ID: SRR21658550
Sample name:
Date: 04-04-2023 02:23:09
Number of reads: 1328043
Percentage reads mapped: 82.17
Strain: lineage1.1.1
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
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Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
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lineage1.1 | Indo-Oceanic | EAI3;EAI4;EAI5;EAI6 | RD239 | 0.99 |
lineage1.1.1 | Indo-Oceanic | EAI4;EAI5 | RD239 | 0.99 |
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Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
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