Run ID: SRR13861576
Sample name:
Date: 03-04-2023 09:35:16
Number of reads: 214355
Percentage reads mapped: 21.46
Strain: lineage4.9
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.9 | Euro-American (H37Rv-like) | T1 | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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gyrA | 9138 | p.Gln613Lys | missense_variant | 1.0 |
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fprA | 3474353 | c.348delT | frameshift_variant | 1.0 |
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ethA | 4326849 | p.Pro209Thr | missense_variant | 1.0 |