Run ID: ERR4821879
Sample name:
Date: 01-04-2023 17:30:27
Number of reads: 2065258
Percentage reads mapped: 86.06
Strain: lineage4.6.1.1
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.6 | Euro-American | T;LAM | None | 1.0 |
lineage4.6.1 | Euro-American (Uganda) | T2 | RD724 | 1.0 |
lineage4.6.1.1 | Euro-American | T2-Uganda | RD724 | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 | streptomycin |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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gyrA | 7539 | p.Thr80Ala | missense_variant | 1.0 |
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