TB-Profiler result

Run: ERR6197022
Summary

Run ID: ERR6197022

Sample name:

Date: 02-04-2023 01:49:20

Number of reads: 45339

Percentage reads mapped: 10.26

Strain: lineage4.9

Drug-resistance: Other

Download CSV Download TXT Download PDF Download JSON
Drug resistance: This table reports drug-resistance associated mutations found in known resistance genes
Drug Resistance Supporting mutations
Lineage Table: The lineage is inferred by analysing lineage specific SNPs
Lineage Family Main Spoligotype RDs Frequency
lineage4 Euro-American LAM;T;S;X;H None 1.0
lineage4.9 Euro-American (H37Rv-like) T1 None 0.98
Drug resistance-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction Drugs
rrs 1472733 n.888G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.57 streptomycin
rrs 1473247 n.1402C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.2 kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin
embB 4247431 p.Met306Ile missense_variant 0.67 ethambutol
Non-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have not been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction
gyrA 7362 p.Glu21Gln missense_variant 1.0
gyrA 9304 p.Gly668Asp missense_variant 1.0
mmpL5 775639 p.Ile948Val missense_variant 1.0
rpsL 781760 c.201T>C synonymous_variant 0.67
rpsL 781766 c.207C>T synonymous_variant 0.67
rpsL 781772 c.213C>T synonymous_variant 0.67
rpsL 781796 p.Met79Ile missense_variant 1.0
rpsL 781802 c.243G>C synonymous_variant 1.0
rpsL 781811 c.252C>T synonymous_variant 1.0
rpsL 781814 c.255C>T synonymous_variant 1.0
rpsL 781817 c.258G>T synonymous_variant 1.0
rpsL 781832 c.273T>C synonymous_variant 1.0
rpsL 781835 c.276T>C synonymous_variant 1.0
rpsL 781841 c.282C>T synonymous_variant 1.0
rpsL 781845 p.Lys96Arg missense_variant 1.0
rpsL 781851 p.Ile98Val missense_variant 1.0
rpsL 781868 c.309T>C synonymous_variant 1.0
rpsL 781871 c.312G>C synonymous_variant 1.0
fbiC 1303714 p.Gly262Ser missense_variant 0.5
Rv1258c 1407498 c.-158G>A upstream_gene_variant 0.5
rrs 1471659 n.-187C>T upstream_gene_variant 1.0
rrs 1471923 n.78T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1471925 n.80_81insGCAGCTTG non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1471928 n.83T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1471930 n.88_89delGA non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrs 1471934 n.89A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrs 1471978 n.133C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrs 1471996 n.151C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrs 1472094 n.249T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrs 1472106 n.261G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrs 1472108 n.263C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1472120 n.281_283delACG non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472129 n.284G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1472130 n.285G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1472137 n.292G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1472150 n.305T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrs 1472151 n.306C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrs 1472152 n.307C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1472160 n.315C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrs 1472172 n.327T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472225 n.380C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrs 1472259 n.414C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472344 n.499C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472435 n.590T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrs 1472438 n.593T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrs 1472439 n.594C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrs 1472447 n.602C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrs 1472448 n.603T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrs 1472450 n.605A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472451 n.606C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472461 n.616G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrs 1472462 n.617T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472464 n.619A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrs 1472471 n.626G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrs 1472484 n.639A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472489 n.644A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472494 n.649A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472498 n.653C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472513 n.668T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1472518 n.673G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrs 1472530 n.685G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1472537 n.692C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.53
rrs 1472541 n.696T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrs 1472544 n.699C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.31
rrs 1472545 n.700A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.21
rrs 1472549 n.704G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1472557 n.712G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.26
rrs 1472558 n.713G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.21
rrs 1472566 n.721G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.28
rrs 1472569 n.724G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrs 1472571 n.726G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.61
rrs 1472573 n.728C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.32
rrs 1472579 n.734G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrs 1472581 n.736A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.63
rrs 1472591 n.746G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.15
rrs 1472598 n.753A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1472599 n.754G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rrs 1472607 n.762G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.24
rrs 1472612 n.767G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1472616 n.771G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472655 n.810G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.89
rrs 1472658 n.813G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrs 1472661 n.816A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472690 n.845C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrs 1472697 n.852T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.61
rrs 1472708 n.863T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrs 1472713 n.868T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.73
rrs 1472715 n.870C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrs 1472716 n.871C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1472742 n.897C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1472744 n.899A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.65
rrs 1472767 n.922G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.32
rrs 1472781 n.936C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.68
rrs 1472786 n.941C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrs 1472793 n.948A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrs 1472803 n.958T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.55
rrs 1472805 n.960C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrs 1472806 n.961A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrs 1472813 n.968A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrs 1472824 n.979T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472887 n.1042G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrs 1472895 n.1050C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.42
rrs 1472936 n.1091C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.23
rrs 1472951 n.1106T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrs 1472953 n.1108G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.19
rrs 1472954 n.1109T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.19
rrs 1472956 n.1111T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrs 1472957 n.1112C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.89
rrs 1472958 n.1113A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.32
rrs 1472959 n.1114T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrs 1472963 n.1118G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.46
rrs 1472973 n.1128A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472974 n.1129A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.23
rrs 1472975 n.1130T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.19
rrs 1472982 n.1137G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrs 1472987 n.1142G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1472987 n.1142G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1472988 n.1143T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.41
rrs 1472989 n.1144G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.46
rrs 1472990 n.1145A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.7
rrs 1472992 n.1147A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrs 1473001 n.1156G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrs 1473002 n.1157G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrs 1473004 n.1159T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.61
rrs 1473005 n.1160C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.32
rrs 1473008 n.1163C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrs 1473009 n.1164T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrs 1473020 n.1175T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrs 1473035 n.1190G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.69
rrs 1473044 n.1199C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.28
rrs 1473051 n.1206T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.23
rrs 1473053 n.1208T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrs 1473055 n.1210C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrs 1473056 n.1211A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.61
rrs 1473062 n.1217T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.39
rrs 1473066 n.1221A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrs 1473068 n.1223A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrs 1473080 n.1235C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.73
rrs 1473088 n.1243A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1473089 n.1244A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1473091 n.1246G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1473093 n.1248C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrs 1473094 n.1249T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.56
rrs 1473099 n.1254T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1473100 n.1255G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1473102 n.1257C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1473104 n.1259C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1473110 n.1265T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1473111 n.1266A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1473120 n.1275C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.56
rrs 1473121 n.1276T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.73
rrs 1473123 n.1278A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrs 1473132 n.1287T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrs 1473135 n.1290C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrs 1473145 n.1300C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.79
rrs 1473148 n.1303G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.21
rrs 1473163 n.1318C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.19
rrs 1473166 n.1321G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.81
rrs 1473177 n.1332G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrs 1473192 n.1347A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrs 1473193 n.1348G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrs 1473204 n.1359C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.15
rrs 1473205 n.1360T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.31
rrs 1473248 n.1403G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1473249 n.1404T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1473252 n.1407T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1473259 n.1414C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.9
rrs 1473270 n.1425G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1473276 n.1431A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrs 1473285 n.1442_1443delCC non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1473292 n.1447G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1473293 n.1448G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1473301 n.1456T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrs 1473305 n.1460G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrs 1473316 n.1471C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1474164 n.507C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474171 n.514C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474181 n.524C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474184 n.527C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474185 n.528G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474197 n.540C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474199 n.542G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474202 n.545T>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474249 n.592G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474476 n.819C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1474488 n.831G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474495 n.838G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1474496 n.839C>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474497 n.840G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1474506 n.849C>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474507 n.850G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474508 n.851C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1474516 n.859C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1474529 n.872A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1474530 n.873G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1474537 n.880G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474539 n.882C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1474540 n.883T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1474558 n.901G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1474584 n.927C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1474673 n.1016T>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474674 n.1018delC non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474677 n.1020A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474709 n.1052G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474734 n.1077G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474749 n.1092C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474753 n.1097delC non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474760 n.1103A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1474777 n.1120T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474779 n.1122G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1474782 n.1125G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1474794 n.1137C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474801 n.1144G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1474802 n.1145T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1474812 n.1155G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1474819 n.1162T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1474823 n.1166C>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474825 n.1168G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1474827 n.1170C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474830 n.1173A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474831 n.1174A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1474832 n.1175A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1474864 n.1207C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474883 n.1226T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1474901 n.1244A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474904 n.1247G>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474913 n.1256T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1475672 n.2015C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1475673 n.2016T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1475699 n.2042C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475713 n.2056C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1475753 n.2096C>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475775 n.2118G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475783 n.2126T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1475803 n.2146T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1475804 n.2147G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1475816 n.2159C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1475817 n.2160A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1475869 n.2212C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrl 1475881 n.2224T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.73
rrl 1475883 n.2226A>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475884 n.2227A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1475896 n.2239A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.27
rrl 1475897 n.2240T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1475898 n.2241A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1475899 n.2242G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1475900 n.2243A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrl 1475902 n.2245T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrl 1475906 n.2249C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1475916 n.2259C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1475937 n.2280A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrl 1475943 n.2286G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.55
rrl 1475945 n.2288C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrl 1475952 n.2295A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1475970 n.2313C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrl 1475975 n.2318C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrl 1475977 n.2320A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1475988 n.2331A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1475997 n.2340A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1476194 n.2537A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476200 n.2543A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1476201 n.2544C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1476214 n.2557G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476215 n.2558C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476224 n.2567A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476225 n.2568T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1476245 n.2588C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrl 1476250 n.2593C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476251 n.2594T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476252 n.2595T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1476256 n.2599A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrl 1476257 n.2600G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476260 n.2603A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1476280 n.2623A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrl 1476281 n.2624T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1476293 n.2636C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476294 n.2637A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476295 n.2638C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476296 n.2639C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476297 n.2640C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1476301 n.2644A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1476302 n.2645G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1476311 n.2654G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476312 n.2655T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476313 n.2656G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1476332 n.2675G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrl 1476336 n.2679C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.21
rrl 1476338 n.2681C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1476353 n.2696G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1476356 n.2699C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.16
rrl 1476357 n.2700T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrl 1476358 n.2701T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.87
rrl 1476359 n.2702C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1476369 n.2712C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrl 1476372 n.2715T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1476381 n.2724G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrl 1476382 n.2725A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.79
rrl 1476383 n.2726T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.73
rrl 1476384 n.2727G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.16
rrl 1476408 n.2751G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1476411 n.2754G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrl 1476425 n.2768G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.63
rrl 1476428 n.2771C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.85
rrl 1476429 n.2772A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrl 1476443 n.2786G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.15
rrl 1476456 n.2799A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrl 1476463 n.2806C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.21
rrl 1476466 n.2809C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrl 1476481 n.2824T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrl 1476506 n.2849T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrl 1476514 n.2857C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrl 1476515 n.2858C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1476517 n.2860C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrl 1476519 n.2862C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrl 1476524 n.2867C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1476525 n.2868A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476530 n.2873C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrl 1476537 n.2880A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1476538 n.2881A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrl 1476539 n.2882A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1476540 n.2883C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1476547 n.2890C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrl 1476567 n.2910C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476584 n.2927C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1476585 n.2928A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476594 n.2937C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476603 n.2946G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476607 n.2950C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476608 n.2951C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476614 n.2957A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476616 n.2959A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476619 n.2962C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1476628 n.2971T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1476629 n.2972C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476630 n.2973A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476661 n.3004A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476665 n.3008T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476668 n.3011C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476675 n.3018C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476678 n.3021G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.5
tlyA 1917972 c.33A>G synonymous_variant 1.0
Rv1979c 2223293 c.-129A>G upstream_gene_variant 1.0
fprA 3473996 c.-11_-10insA upstream_gene_variant 0.6
Rv3236c 3612832 c.285C>T synonymous_variant 1.0
alr 3840719 c.702A>G synonymous_variant 1.0
clpC1 4038287 c.2418C>T synonymous_variant 1.0
clpC1 4039193 c.1512C>A synonymous_variant 1.0
embA 4242643 c.-590C>T upstream_gene_variant 1.0