Run ID: ERR4817555
Sample name:
Date: 01-04-2023 15:03:33
Number of reads: 948154
Percentage reads mapped: 90.73
Strain: lineage3
Drug-resistance: RR-TB
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage3 | East-African-Indian | CAS | RD750 | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
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Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrA | 7362 | p.Glu21Gln | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 9304 | p.Gly668Asp | missense_variant | 1.0 |
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rpoB | 759818 | c.12C>T | synonymous_variant | 1.0 |
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rpoC | 764692 | c.1323C>T | synonymous_variant | 0.11 |
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mmpL5 | 776100 | p.Thr794Ile | missense_variant | 1.0 |
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