Run ID: SRR13861521
Sample name:
Date: 03-04-2023 09:33:51
Number of reads: 177943
Percentage reads mapped: 5.94
Strain: lineage4.9
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.9 | Euro-American (H37Rv-like) | T1 | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 | streptomycin |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
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mmpL5 | 777800 | c.681C>T | synonymous_variant | 1.0 |
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