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Run: ERR4818556

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Run ID: ERR4818556

Sample name:

Date: 01-04-2023 15:37:36

Number of reads: 1064796

Percentage reads mapped: 87.52

Strain: lineage3

Drug-resistance: Other


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Drug resistance: This table reports drug-resistance associated mutations found in known resistance genes
Drug Resistance Supporting mutations
Lineage Table: The lineage is inferred by analysing lineage specific SNPs
Lineage Family Main Spoligotype RDs Frequency
lineage3 East-African-Indian CAS RD750 1.0
Drug resistance-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction Drugs
rrs 1472733 n.888G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.52 streptomycin
Non-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have not been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction
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gyrA 7585 p.Ser95Thr missense_variant 1.0
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fgd1 491742 c.960T>C synonymous_variant 1.0
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