Run ID: SRR6982198
Sample name:
Date: 04-04-2023 18:30:16
Number of reads: 284073
Percentage reads mapped: 76.7
Strain: lineage1
Drug-resistance: HR-TB
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
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lineage1 | Indo-Oceanic | EAI | RD239 | 0.91 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
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Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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Rv1258c | 1406387 | c.954C>T | synonymous_variant | 0.29 |
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