Run ID: ERR164004
Sample name:
Date: 31-03-2023 14:52:12
Number of reads: 94393
Percentage reads mapped: 3.17
Strain: lineage4.9;lineage4.3
Drug-resistance: Sensitive
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.3 | Euro-American (LAM) | mainly-LAM | None | 0.06 |
lineage4.9 | Euro-American (H37Rv-like) | T1 | None | 0.97 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 8715 | p.Pro472Ser | missense_variant | 1.0 |
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