Run ID: ERR245740
Sample name:
Date: 31-03-2023 18:18:13
Number of reads: 9256985
Percentage reads mapped: 65.18
Strain: lineage4.1.2
Drug-resistance: Sensitive
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.1 | Euro-American | T;X;H | None | 1.0 |
lineage4.1.2 | Euro-American | T;H | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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gyrA | 7362 | p.Glu21Gln | missense_variant | 1.0 |
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rpoC | 767305 | p.Tyr1312* | stop_gained | 0.17 |
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mmpL5 | 777399 | p.Thr361Arg | missense_variant | 0.15 |
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fbiB | 3642734 | c.1200G>C | synonymous_variant | 0.16 |
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