Run ID: ERR216930
Sample name:
Date: 31-03-2023 15:56:02
Number of reads: 1486752
Percentage reads mapped: 40.36
Strain: lineage4.3.4.1
Drug-resistance: Sensitive
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.3 | Euro-American (LAM) | mainly-LAM | None | 1.0 |
lineage4.3.4 | Euro-American (LAM) | LAM | RD174 | 1.0 |
lineage4.3.4.1 | Euro-American (LAM) | LAM1;LAM2 | RD174 | 0.97 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
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tlyA | 1917972 | c.33A>G | synonymous_variant | 1.0 |
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gid | 4407854 | p.Gly117Arg | missense_variant | 1.0 |
gid | 4408156 | p.Leu16Arg | missense_variant | 1.0 |