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Run: ERR4187921
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Run ID: ERR4187921

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Date: 01-04-2023 04:48:29

Number of reads: 148730

Percentage reads mapped: 4.78

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Drug-resistance: Other

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Drug resistance: This table reports drug-resistance associated mutations found in known resistance genes
Drug Resistance Supporting mutations
Lineage Table: The lineage is inferred by analysing lineage specific SNPs
Lineage Family Main Spoligotype RDs Frequency
Drug resistance-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction Drugs
pncA 2289073 p.His57Asp missense_variant 1.0 pyrazinamide
Non-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have not been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction
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mmpL5 776100 p.Thr794Ile missense_variant 1.0
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ndh 2103173 c.-132delG upstream_gene_variant 1.0
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