Run ID: ERR4814617
Sample name:
Date: 01-04-2023 13:23:52
Number of reads: 1025033
Percentage reads mapped: 55.97
Strain: lineage1.1.3.1
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
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Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
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lineage1.1 | Indo-Oceanic | EAI3;EAI4;EAI5;EAI6 | RD239 | 1.0 |
lineage1.1.3 | Indo-Oceanic | EAI6 | RD239 | 1.0 |
lineage1.1.3.1 | Indo-Oceanic | NA | RD239 | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
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rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 | streptomycin |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
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