Run ID: ERR10796580
Sample name:
Date: 31-03-2023 11:11:52
Number of reads: 2418031
Percentage reads mapped: 99.99
Strain: lineage4.6
Drug-resistance: RR-TB
Drug | Resistance | Supporting mutations |
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Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
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lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 0.97 |
lineage4.6 | Euro-American | T;LAM | None | 0.08 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
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Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrB | 5070 | c.-170C>T | upstream_gene_variant | 0.33 |
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