Run ID: ERR8025347
Sample name:
Date: 02-04-2023 07:19:38
Number of reads: 5701017
Percentage reads mapped: 62.75
Strain: lineage4.9
Drug-resistance: Sensitive
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.9 | Euro-American (H37Rv-like) | T1 | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
fgd1 | 490809 | p.Lys9Asn | missense_variant | 1.0 |
mshA | 576108 | p.Ala254Gly | missense_variant | 0.31 |
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