Run ID: ERR10796625
Sample name:
Date: 31-03-2023 11:12:45
Number of reads: 3761549
Percentage reads mapped: 100.0
Strain: lineage4.4.1.1
Drug-resistance: RR-TB
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
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lineage4.4 | Euro-American | S;T | None | 1.0 |
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lineage4.4.1.1 | Euro-American | S;Orphans | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
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rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 | streptomycin |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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gyrA | 7362 | p.Glu21Gln | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
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