Run ID: ERR4819002
Sample name:
Date: 01-04-2023 15:52:15
Number of reads: 586778
Percentage reads mapped: 49.98
Strain: lineage4.8
Drug-resistance: HR-TB
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.8 | Euro-American (mainly T) | T1;T2;T3;T5 | RD219 | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
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katG | 2155168 | p.Ser315Thr | missense_variant | 1.0 | isoniazid |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrB | 5709 | p.Gly157Asp | missense_variant | 0.25 |
gyrB | 6707 | p.Lys490Glu | missense_variant | 0.29 |
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