Run ID: 7b906e02-8577-4bb8-a956-d7f0d98fc212
Sample name:
Date: 02-04-2024 23:06:33
Number of reads: 2155
Percentage reads mapped: 98.31
Median coverage: 0
Strain:
Spoligotype:
Drug-resistance: Other
Lineage | Family | RDs | Frequency |
---|
Drug | Resistance | Supporting mutations | WHO confidence | Comment |
---|---|---|---|---|
rifampicin | ||||
isoniazid | ||||
ethambutol | ||||
pyrazinamide | ||||
moxifloxacin | ||||
levofloxacin | ||||
bedaquiline | ||||
delamanid | ||||
pretomanid | ||||
linezolid | ||||
streptomycin | ||||
amikacin | rrs | n.1402C>A | Uncertain significance | |
n.1484G>T | Assoc w R - interim | |||
kanamycin | rrs | n.1402C>A | Uncertain significance | |
n.1484G>T | Assoc w R | |||
capreomycin | rrs | n.1402C>A | Uncertain significance | |
n.1484G>T | Assoc w R | |||
clofazimine | ||||
ethionamide | ||||
para-aminosalicylic_acid | ||||
cycloserine |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs | Confidence | Comment |
---|---|---|---|---|---|---|---|
rrs | 1473247 | n.1402C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | kanamycin | Uncertain significance | |
capreomycin | Uncertain significance | ||||||
aminoglycosides | Uncertain significance | ||||||
amikacin | Uncertain significance | ||||||
rrs | 1473329 | n.1484G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | kanamycin | Assoc w R | |
capreomycin | Assoc w R | ||||||
aminoglycosides | Uncertain significance | ||||||
amikacin | Assoc w R - interim |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs | Confidence |
---|---|---|---|---|---|---|
rrs | 1471858 | n.13A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1471862 | n.17T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471866 | n.21C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471867 | n.22C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471926 | n.81C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471929 | n.84C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471930 | n.85G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471932 | n.87A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471934 | n.89A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1471936 | n.91A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471967 | n.122G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471970 | n.125G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471972 | n.127T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471980 | n.135G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471981 | n.136C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471986 | n.141C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1471993 | n.149_150delGC | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472009 | n.164T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472026 | n.181C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472028 | n.183A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472030 | n.185G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472031 | n.186G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472033 | n.188A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472039 | n.195_198delTCTT | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472047 | n.202_203insGGGT | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472054 | n.210_212delCGC | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472067 | n.222G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472068 | n.223T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472075 | n.230A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472076 | n.231G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472078 | n.233C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472085 | n.240C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472106 | n.261G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472107 | n.262A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472108 | n.263C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | ||||||
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streptomycin | ||||||
rrs | 1472112 | n.267C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472122 | n.277G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472123 | n.278A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472124 | n.279C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
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aminoglycosides | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472225 | n.380C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472240 | n.395G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472251 | n.406G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472279 | n.434T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
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rrs | 1472288 | n.443A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472289 | n.444T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
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rrs | 1472290 | n.445C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472315 | n.470T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472324 | n.479G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472325 | n.480G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472326 | n.481T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
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streptomycin | ||||||
rrs | 1472329 | n.484A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472330 | n.485G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472344 | n.499C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472368 | n.523A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472400 | n.555C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472428 | n.583G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472435 | n.590T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472437 | n.592T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472438 | n.593T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472439 | n.594C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472443 | n.598A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472449 | n.604C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472450 | n.605A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472451 | n.606C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472460 | n.615T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472461 | n.616G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472471 | n.626G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472472 | n.627G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472473 | n.628G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472483 | n.638C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472484 | n.639A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472489 | n.644A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472493 | n.648T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472495 | n.650C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472496 | n.651T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472498 | n.653C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472507 | n.662C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472522 | n.677T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472557 | n.712G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472571 | n.726G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472581 | n.736A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472582 | n.737G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472584 | n.739A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472585 | n.740A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472623 | n.778A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472647 | n.802C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472673 | n.828T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472675 | n.830T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472677 | n.832C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472682 | n.837T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472683 | n.838T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472687 | n.842A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472692 | n.847T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472707 | n.862A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472767 | n.922G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472790 | n.945T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472812 | n.967A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472837 | n.992C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472843 | n.999_1001delCGC | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472857 | n.1012A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472860 | n.1015C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472862 | n.1017_1018insGCC | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472865 | n.1020C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472866 | n.1021C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472870 | n.1025T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472873 | n.1028C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472875 | n.1030T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472878 | n.1033G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472879 | n.1034T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472880 | n.1035G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472954 | n.1110delC | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472958 | n.1113_1114insC | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472973 | n.1128A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472986 | n.1141_1142insA | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472989 | n.1145delA | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472996 | n.1151T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1473066 | n.1221A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473081 | n.1236C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1473088 | n.1243A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473091 | n.1246G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473093 | n.1248C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473094 | n.1249T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473099 | n.1254T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473100 | n.1255G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473102 | n.1257C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1473104 | n.1259C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473109 | n.1264T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473111 | n.1266A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473120 | n.1275C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473121 | n.1276T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473122 | n.1277T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473123 | n.1278A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1473145 | n.1300C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473164 | n.1319C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473166 | n.1321G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473226 | n.1381C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473259 | n.1414C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473276 | n.1431A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473288 | n.1443C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1473290 | n.1445C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473301 | n.1456T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473315 | n.1470T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473316 | n.1471C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473319 | n.1474C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473324 | n.1479G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473346 | n.1501G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1473348 | n.1503C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 | linezolid | |
kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin |