Run ID: ERR10796631
Sample name:
Date: 31-03-2023 11:12:53
Number of reads: 210012
Percentage reads mapped: 99.99
Strain: lineage4.3.4
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.3.4 | Euro-American (LAM) | LAM | RD174 | 0.05 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
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Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrA | 8637 | c.1336C>T | synonymous_variant | 0.5 |
gyrA | 9304 | p.Gly668Asp | missense_variant | 1.0 |
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