Run ID: ERR10796561
Sample name:
Date: 31-03-2023 11:11:32
Number of reads: 5104411
Percentage reads mapped: 100.0
Strain: lineage4.3.2
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.3 | Euro-American (LAM) | mainly-LAM | None | 1.0 |
lineage4.3.2 | Euro-American (LAM) | LAM3 | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
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pncA | 2288879 | c.361_362delCG | frameshift_variant | 0.12 | pyrazinamide |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
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gyrB | 5502 | p.Thr88Ile | missense_variant | 0.29 |
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gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
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rpoC | 764995 | c.1626C>G | synonymous_variant | 1.0 |
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