Run ID: ERR10796558
Sample name:
Date: 31-03-2023 11:11:27
Number of reads: 739652
Percentage reads mapped: 100.0
Strain: lineage4
Drug-resistance: Sensitive
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrA | 7362 | p.Glu21Gln | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 7585 | p.Ser95Thr | missense_variant | 1.0 |
gyrA | 9304 | p.Gly668Asp | missense_variant | 1.0 |
rpoB | 761123 | c.1317G>C | synonymous_variant | 0.67 |
rpoB | 761232 | p.Arg476Trp | missense_variant | 0.5 |
rpoB | 762041 | c.2235C>T | synonymous_variant | 0.29 |
rpoB | 762493 | p.Glu896Gly | missense_variant | 0.5 |
rpoC | 762902 | c.-468C>T | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 762911 | c.-459C>T | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 762917 | c.-453C>T | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 762920 | c.-450C>T | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 762929 | c.-441G>C | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 762944 | c.-426C>T | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 762956 | c.-414G>C | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 762962 | c.-408C>T | upstream_gene_variant | 0.33 |
rpoC | 762980 | c.-390T>C | upstream_gene_variant | 0.33 |
rpoC | 762983 | c.-387C>T | upstream_gene_variant | 0.33 |
rpoC | 762989 | c.-381G>C | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 762995 | c.-375G>T | upstream_gene_variant | 0.4 |
rpoC | 764995 | c.1626C>G | synonymous_variant | 1.0 |
mmpL5 | 775639 | p.Ile948Val | missense_variant | 1.0 |
rpsL | 781395 | c.-165T>C | upstream_gene_variant | 1.0 |
rplC | 800840 | p.Leu11Pro | missense_variant | 0.33 |
rrs | 1471659 | n.-187C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
rrs | 1472068 | n.223T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrs | 1472075 | n.230A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrs | 1472078 | n.233C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrs | 1472108 | n.263C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrs | 1472122 | n.277G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrs | 1472123 | n.278A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrs | 1472124 | n.279C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrs | 1472148 | n.303T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1472150 | n.305T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrs | 1472155 | n.310C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrs | 1472160 | n.315C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrs | 1472172 | n.327T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrs | 1472225 | n.380C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrs | 1472251 | n.406G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrs | 1472258 | n.413A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrs | 1472259 | n.414C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrs | 1472285 | n.440A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472344 | n.499C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472379 | n.534T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472400 | n.555C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472412 | n.567A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472416 | n.571C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472422 | n.577T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrs | 1472462 | n.617T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472464 | n.619A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472473 | n.628G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472474 | n.629C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472476 | n.631A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472484 | n.639A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1472489 | n.644A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.59 |
rrs | 1472494 | n.649A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrs | 1472496 | n.651T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1472498 | n.653C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrs | 1472513 | n.668T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrs | 1472549 | n.704G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrs | 1472558 | n.713G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrs | 1472569 | n.724G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1472581 | n.736A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrs | 1472581 | n.736A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrs | 1472584 | n.739A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1472647 | n.802C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrs | 1472655 | n.810G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrs | 1472660 | n.815T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrs | 1472686 | n.841G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrs | 1472687 | n.842A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1472690 | n.845C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.72 |
rrs | 1472692 | n.847T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrs | 1472707 | n.862A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrs | 1472713 | n.868T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.12 |
rrs | 1472714 | n.869A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrs | 1472742 | n.897C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1472744 | n.899A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1472755 | n.910G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrs | 1472781 | n.936C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1472786 | n.941C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrs | 1472790 | n.945T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.66 |
rrs | 1472793 | n.948A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrs | 1472803 | n.958T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.13 |
rrs | 1472824 | n.979T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrs | 1472825 | n.980G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrs | 1472828 | n.983T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrs | 1472840 | n.995A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1472875 | n.1030T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472895 | n.1050C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1472954 | n.1109T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrs | 1472956 | n.1111T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrs | 1472957 | n.1112C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1472973 | n.1128A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1472973 | n.1128A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrs | 1472987 | n.1142G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrs | 1472990 | n.1145A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrs | 1472992 | n.1147A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrs | 1473005 | n.1160C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrs | 1473035 | n.1190G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1473055 | n.1210C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1473056 | n.1211A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473066 | n.1221A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1473080 | n.1235C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrs | 1473081 | n.1236C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrs | 1473088 | n.1243A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473093 | n.1248C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1473100 | n.1255G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1473101 | n.1256C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1473102 | n.1257C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrs | 1473104 | n.1259C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1473110 | n.1265T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473111 | n.1266A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473115 | n.1270G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1473121 | n.1276T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1473123 | n.1278A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrs | 1473130 | n.1285G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.66 |
rrs | 1473145 | n.1300C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473166 | n.1321G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473172 | n.1327T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrs | 1473173 | n.1328C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrs | 1473221 | n.1376C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrs | 1473252 | n.1407T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1473259 | n.1414C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473276 | n.1431A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473277 | n.1432G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrs | 1473293 | n.1449delA | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrs | 1473300 | n.1455C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrs | 1473301 | n.1456T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1473316 | n.1471C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1473384 | n.-274A>G | upstream_gene_variant | 0.63 |
rrl | 1473390 | n.-268A>C | upstream_gene_variant | 0.12 |
rrl | 1474164 | n.507C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 |
rrl | 1474181 | n.524C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1474184 | n.527C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1474197 | n.540C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1474199 | n.542G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1474200 | n.545delT | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1474249 | n.592G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrl | 1474271 | n.614A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrl | 1474272 | n.615C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrl | 1474275 | n.618T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrl | 1474467 | n.810A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474483 | n.826C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1474488 | n.831G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474495 | n.838G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1474496 | n.839C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474497 | n.840G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrl | 1474506 | n.849C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 |
rrl | 1474508 | n.851C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1474516 | n.859C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrl | 1474527 | n.870T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrl | 1474528 | n.871T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.53 |
rrl | 1474529 | n.872A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1474537 | n.880G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474540 | n.883T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1474551 | n.894G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1474626 | n.969T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474634 | n.977T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.87 |
rrl | 1474677 | n.1020A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1474709 | n.1052G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1474734 | n.1077G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1474749 | n.1092C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrl | 1474753 | n.1097delC | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1474760 | n.1103A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1474779 | n.1122G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrl | 1474780 | n.1123C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrl | 1474782 | n.1125G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1474794 | n.1137C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1474801 | n.1144G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrl | 1474802 | n.1145T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474823 | n.1166C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.87 |
rrl | 1474830 | n.1173A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1474831 | n.1174A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1474832 | n.1175A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrl | 1474864 | n.1207C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474901 | n.1244A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1474904 | n.1247G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1474913 | n.1256T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrl | 1474933 | n.1276A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474934 | n.1277C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrl | 1475078 | n.1421T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1475314 | n.1657A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1475672 | n.2015C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1475673 | n.2016T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrl | 1475686 | n.2029C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1475696 | n.2039T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1475699 | n.2042C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1475703 | n.2046A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1475715 | n.2058G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1475722 | n.2065G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrl | 1475751 | n.2094C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1475751 | n.2094C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1475753 | n.2096C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrl | 1475756 | n.2099T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrl | 1475758 | n.2101A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrl | 1475760 | n.2103C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrl | 1475777 | n.2120A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1475783 | n.2126T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrl | 1475791 | n.2134A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrl | 1475881 | n.2224T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1475883 | n.2226A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrl | 1475884 | n.2227A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1475892 | n.2235A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1475896 | n.2239A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1475897 | n.2240T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrl | 1475897 | n.2240T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrl | 1475898 | n.2241A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475899 | n.2242G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475900 | n.2243A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrl | 1475906 | n.2249C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1475916 | n.2259C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475937 | n.2280A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1475938 | n.2281C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrl | 1475943 | n.2286G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrl | 1475945 | n.2288C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrl | 1475952 | n.2295A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrl | 1475970 | n.2313C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1475975 | n.2318C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.72 |
rrl | 1475977 | n.2320A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1475988 | n.2331A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1475995 | n.2338G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrl | 1476131 | n.2474C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1476164 | n.2507A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.41 |
rrl | 1476165 | n.2508T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1476179 | n.2522C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1476194 | n.2537A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrl | 1476197 | n.2540T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrl | 1476200 | n.2543A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1476201 | n.2544C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1476204 | n.2547C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1476209 | n.2552A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.15 |
rrl | 1476214 | n.2557G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1476215 | n.2558C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1476221 | n.2564T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1476224 | n.2567A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrl | 1476227 | n.2570C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1476245 | n.2588C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1476252 | n.2595T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1476253 | n.2596A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1476255 | n.2598A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1476256 | n.2599A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1476260 | n.2603A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1476280 | n.2623A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1476281 | n.2624T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1476293 | n.2636C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476294 | n.2637A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1476295 | n.2638C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1476296 | n.2639C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1476297 | n.2640C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476301 | n.2644A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1476311 | n.2654G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1476312 | n.2655T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1476313 | n.2656G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1476332 | n.2675G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrl | 1476336 | n.2679C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrl | 1476338 | n.2681C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476353 | n.2696G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1476357 | n.2700T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1476358 | n.2701T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1476359 | n.2702C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrl | 1476368 | n.2711T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrl | 1476369 | n.2712C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1476372 | n.2715T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrl | 1476381 | n.2724G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1476382 | n.2725A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.49 |
rrl | 1476383 | n.2726T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrl | 1476411 | n.2754G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrl | 1476425 | n.2768G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrl | 1476428 | n.2771C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrl | 1476429 | n.2772A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.41 |
rrl | 1476463 | n.2806C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1476466 | n.2809C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrl | 1476481 | n.2824T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrl | 1476506 | n.2849T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1476513 | n.2856G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1476514 | n.2857C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.13 |
rrl | 1476515 | n.2858C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1476517 | n.2860C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrl | 1476519 | n.2862C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.14 |
rrl | 1476523 | n.2866T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrl | 1476524 | n.2867C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1476525 | n.2868A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrl | 1476536 | n.2879G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1476538 | n.2881A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrl | 1476539 | n.2882A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrl | 1476540 | n.2883C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrl | 1476542 | n.2885T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrl | 1476567 | n.2910C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1476584 | n.2927C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1476585 | n.2928A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1476594 | n.2937C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
fabG1 | 1673839 | p.Arg134* | stop_gained | 0.67 |
rpsA | 1834561 | c.1020C>T | synonymous_variant | 0.5 |
tlyA | 1917750 | c.-190A>G | upstream_gene_variant | 0.4 |
tlyA | 1917972 | c.33A>G | synonymous_variant | 1.0 |
katG | 2154445 | p.Ala556Glu | missense_variant | 0.29 |
katG | 2154750 | p.Glu454Asp | missense_variant | 0.33 |
katG | 2155268 | p.Asp282Asn | missense_variant | 0.33 |
katG | 2155359 | c.753G>T | synonymous_variant | 0.33 |
PPE35 | 2170663 | c.-51G>A | upstream_gene_variant | 0.29 |
Rv1979c | 2222395 | p.Pro257Leu | missense_variant | 1.0 |
Rv1979c | 2223071 | p.Ile32Phe | missense_variant | 0.33 |
Rv1979c | 2223123 | c.42G>A | synonymous_variant | 1.0 |
Rv1979c | 2223293 | c.-129A>G | upstream_gene_variant | 1.0 |
Rv2752c | 3065428 | p.Leu255Ser | missense_variant | 0.33 |
thyX | 3068052 | c.-107C>T | upstream_gene_variant | 0.5 |
thyA | 3073868 | p.Thr202Ala | missense_variant | 1.0 |
fprA | 3473996 | c.-11_-10insA | upstream_gene_variant | 1.0 |
whiB7 | 3568445 | p.His79Asn | missense_variant | 0.4 |
whiB7 | 3568524 | p.Cys52* | stop_gained | 0.33 |
Rv3236c | 3612009 | p.Ala370Thr | missense_variant | 1.0 |
clpC1 | 4038287 | c.2418C>T | synonymous_variant | 1.0 |
embA | 4242643 | c.-590C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
embA | 4243708 | p.Ala159Val | missense_variant | 0.29 |
embA | 4244566 | p.Arg445His | missense_variant | 0.33 |
aftB | 4267909 | c.925_927delCCG | conservative_inframe_deletion | 1.0 |
whiB6 | 4338595 | c.-75delG | upstream_gene_variant | 1.0 |