Run ID: a484d53f-623e-4c21-a305-e9271fc492b5
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Date: 20-07-2023 14:10:04
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Median coverage: 0
Strain:
Spoligotype:
Drug-resistance: Sensitive
Lineage | Family | RDs | Frequency |
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Drug | Resistance | Supporting mutations | WHO confidence | Comment |
---|---|---|---|---|
rifampicin | ||||
isoniazid | ||||
ethambutol | ||||
pyrazinamide | ||||
moxifloxacin | ||||
levofloxacin | ||||
bedaquiline | ||||
delamanid | ||||
pretomanid | ||||
linezolid | ||||
streptomycin | ||||
amikacin | ||||
kanamycin | ||||
capreomycin | ||||
clofazimine | ||||
ethionamide | ||||
para-aminosalicylic_acid | ||||
cycloserine |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs | Confidence | Comment |
---|
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs | Confidence |
---|---|---|---|---|---|---|
rrs | 1471929 | n.84C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 | linezolid | |
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capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1471972 | n.127T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472041 | n.196C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
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aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | Uncertain significance | |||||
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aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
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aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472290 | n.445C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472301 | n.456C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
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aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472344 | n.499C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
rrs | 1472379 | n.534T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472400 | n.555C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472422 | n.577T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472473 | n.628G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472474 | n.629C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472476 | n.631A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
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kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | ||||||
amikacin | Uncertain significance | |||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | ||||||
rrs | 1472498 | n.653C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 | linezolid | |
kanamycin | ||||||
capreomycin | ||||||
amikacin | ||||||
aminoglycosides | ||||||
streptomycin | Uncertain significance | |||||
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kanamycin | Uncertain significance | |||||
capreomycin | Uncertain significance | |||||
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aminoglycosides | ||||||
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streptomycin | ||||||
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