TB-Profiler result

Run: SRR18002887
Summary

Run ID: SRR18002887

Sample name:

Date: 03-04-2023 19:08:10

Number of reads: 3123171

Percentage reads mapped: 75.64

Strain: lineage2.2.1.1

Drug-resistance: MDR-TB

Download CSV Download TXT Download PDF Download JSON
Drug resistance: This table reports drug-resistance associated mutations found in known resistance genes
Drug Resistance Supporting mutations
Lineage Table: The lineage is inferred by analysing lineage specific SNPs
Lineage Family Main Spoligotype RDs Frequency
lineage2 East-Asian Beijing RD105 1.0
lineage2.2 East-Asian (Beijing) Beijing-RD207 RD105;RD207 1.0
lineage2.2.1 East-Asian (Beijing) Beijing-RD181 RD105;RD207;RD181 1.0
lineage2.2.1.1 East-Asian (Beijing) Beijing-RD150 RD105;RD207;RD181;RD150 1.0
Drug resistance-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction Drugs
rpoB 761155 p.Ser450Leu missense_variant 0.97 rifampicin
rpsL 781687 p.Lys43Arg missense_variant 1.0 streptomycin
rrs 1472644 n.799C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.78 streptomycin
rrs 1472733 n.888G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.2 streptomycin
rrs 1473247 n.1402C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.67 kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin
rrs 1473329 n.1484G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.58 kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin
katG 2155168 p.Ser315Thr missense_variant 1.0 isoniazid
embB 4247429 p.Met306Val missense_variant 1.0 ethambutol
Non-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have not been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction
gyrA 7362 p.Glu21Gln missense_variant 1.0
gyrA 7585 p.Ser95Thr missense_variant 1.0
gyrA 9304 p.Gly668Asp missense_variant 1.0
fgd1 491742 c.960T>C synonymous_variant 1.0
mshA 575907 p.Ala187Val missense_variant 1.0
mshA 576108 p.Ala254Gly missense_variant 0.36
ccsA 620625 p.Ile245Met missense_variant 1.0
rpoC 763031 c.-339T>C upstream_gene_variant 1.0
rpoC 763622 p.Ala85Ser missense_variant 0.11
rpoC 763633 c.264T>C synonymous_variant 0.12
rpoC 763660 c.291T>G synonymous_variant 0.11
rpoC 763666 c.297G>C synonymous_variant 0.11
rpoC 763699 c.330G>T synonymous_variant 0.12
rpoC 763705 c.336G>C synonymous_variant 0.11
rpoC 763708 c.339G>C synonymous_variant 0.12
rpoC 763717 c.348T>C synonymous_variant 0.11
rpoC 764677 c.1308C>G synonymous_variant 0.1
rpoC 764678 p.Lys437Glu missense_variant 0.1
rpoC 764701 c.1332C>G synonymous_variant 0.11
rpoC 764724 p.Phe452Cys missense_variant 0.86
mmpL5 775639 p.Ile948Val missense_variant 1.0
mmpL5 776100 p.Thr794Ile missense_variant 1.0
mmpL5 776182 p.Asp767Asn missense_variant 1.0
mmpS5 779615 c.-710C>G upstream_gene_variant 1.0
rpsL 781395 c.-165T>C upstream_gene_variant 1.0
Rv1258c 1406760 c.580_581insC frameshift_variant 1.0
rrs 1471659 n.-187C>T upstream_gene_variant 0.98
rrs 1472102 n.257G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrs 1472106 n.261G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrs 1472108 n.263C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrs 1472112 n.267C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.52
rrs 1472150 n.305T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.77
rrs 1472172 n.327T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472251 n.406G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.82
rrs 1472282 n.437T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472284 n.439C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.7
rrs 1472286 n.441C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.7
rrs 1472293 n.448C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.7
rrs 1472297 n.453_465delGTCCGGGTTCTCT non_coding_transcript_exon_variant 0.7
rrs 1472315 n.470T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1472328 n.483G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1472332 n.487A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1472333 n.488G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1472338 n.493A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrs 1472344 n.499C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrs 1472379 n.534T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472400 n.555C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrs 1472485 n.640G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.25
rrs 1472494 n.649A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrs 1472496 n.651T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrs 1472498 n.653C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrs 1472507 n.662C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.16
rrs 1472518 n.673G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.11
rrs 1472536 n.691G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.71
rrs 1472558 n.713G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrs 1472569 n.724G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrs 1472581 n.736A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.88
rrs 1472597 n.752G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrs 1472607 n.762G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.81
rrs 1472655 n.810G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.94
rrs 1472658 n.813G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.15
rrs 1472660 n.815T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrs 1472661 n.816A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.16
rrs 1472680 n.835C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.15
rrs 1472689 n.844C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrs 1472690 n.845C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrs 1472692 n.847T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrs 1472713 n.868T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrs 1472714 n.869A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.7
rrs 1472716 n.871C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrs 1472742 n.897C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrs 1472744 n.899A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.21
rrs 1472790 n.945T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.65
rrs 1472824 n.979T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrs 1472825 n.980G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrs 1472828 n.983T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrs 1472842 n.997G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrs 1472843 n.998A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1472849 n.1005delT non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrs 1472856 n.1012delA non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrs 1472861 n.1018dupT non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrs 1472874 n.1029C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.71
rrs 1472875 n.1030T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.71
rrs 1472880 n.1035G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.73
rrs 1472895 n.1050C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrs 1472952 n.1107T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1472955 n.1110C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1472956 n.1111T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1472957 n.1112C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1472968 n.1124_1130delACGTAAT non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrs 1472978 n.1133_1134insTCGGCC non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1472987 n.1142G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1472989 n.1144G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1472990 n.1145A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrs 1473035 n.1190G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrs 1473055 n.1210C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1473056 n.1211A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.61
rrs 1473066 n.1221A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrs 1473088 n.1243A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrs 1473093 n.1248C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.56
rrs 1473100 n.1255G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrs 1473102 n.1257C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrs 1473104 n.1259C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrs 1473110 n.1265T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrs 1473111 n.1266A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrs 1473115 n.1270G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrs 1473121 n.1276T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrs 1473123 n.1278A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrs 1473145 n.1300C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrs 1473166 n.1321G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrs 1473252 n.1407T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.68
rrs 1473259 n.1414C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.66
rrs 1473276 n.1431A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.65
rrs 1473290 n.1445C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.63
rrs 1473301 n.1456T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1473316 n.1471C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1473965 n.308G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.15
rrl 1474151 n.494C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1474155 n.498G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1474164 n.507C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1474171 n.514C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1474184 n.527C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrl 1474185 n.529delA non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrl 1474197 n.540C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrl 1474202 n.545T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrl 1474269 n.612C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474275 n.618T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474280 n.623C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474282 n.625G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474287 n.630T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1474289 n.633_647delTTTTCCTCTCCGGAG non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrl 1474306 n.649A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrl 1474308 n.651G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrl 1474310 n.653T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1474315 n.658A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1474348 n.691C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rrl 1474351 n.694G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrl 1474353 n.696A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrl 1474354 n.697C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrl 1474355 n.698A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rrl 1474362 n.705A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rrl 1474384 n.727C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474387 n.730C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1474454 n.797G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrl 1474476 n.819C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474488 n.831G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1474495 n.838G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474498 n.841G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474505 n.848C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474508 n.851C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474516 n.859C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrl 1474527 n.870T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.81
rrl 1474537 n.880G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.81
rrl 1474542 n.885A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.81
rrl 1474558 n.901G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1474584 n.927C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.88
rrl 1474629 n.972G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrl 1474632 n.975G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.82
rrl 1474636 n.979A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.82
rrl 1474637 n.980C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.82
rrl 1474638 n.981C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.85
rrl 1474639 n.982G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.85
rrl 1474652 n.995T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.82
rrl 1474663 n.1006C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1474673 n.1016T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1474674 n.1017A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1474675 n.1018C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1474676 n.1019T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1474677 n.1020A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1474690 n.1033C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.56
rrl 1474694 n.1037C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1474760 n.1103A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrl 1474777 n.1120T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.41
rrl 1474779 n.1122G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.41
rrl 1474780 n.1123C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrl 1474782 n.1125G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrl 1474783 n.1126G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrl 1474794 n.1137C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1474823 n.1166C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.63
rrl 1474827 n.1170C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.63
rrl 1474830 n.1173A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1474831 n.1174A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1474864 n.1207C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrl 1474904 n.1247G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1474932 n.1275C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1475610 n.1953G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrl 1475699 n.2042C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.65
rrl 1475707 n.2050T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.71
rrl 1475722 n.2065G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrl 1475751 n.2094C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrl 1475752 n.2095C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrl 1475753 n.2096C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrl 1475758 n.2101A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrl 1475769 n.2112T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1475775 n.2118G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrl 1475777 n.2120A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrl 1475869 n.2212C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.76
rrl 1475881 n.2224T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.71
rrl 1475883 n.2226A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.71
rrl 1475898 n.2241A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.77
rrl 1475899 n.2242G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrl 1475906 n.2249C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrl 1475916 n.2259C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1475937 n.2280A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.73
rrl 1475943 n.2286G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1475952 n.2295A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.65
rrl 1475963 n.2306G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.56
rrl 1475970 n.2313C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.49
rrl 1475975 n.2318C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrl 1475977 n.2320A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrl 1475978 n.2321C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.49
rrl 1475988 n.2331A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1475993 n.2336C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.37
rrl 1475996 n.2339T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrl 1475997 n.2340A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrl 1475998 n.2341C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.36
rrl 1476001 n.2344T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrl 1476030 n.2373A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.31
rrl 1476032 n.2375C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.12
rrl 1476033 n.2376T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1476034 n.2377C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.15
rrl 1476035 n.2378G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrl 1476040 n.2383C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1476044 n.2387T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1476046 n.2389G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1476049 n.2392C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1476115 n.2458T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrl 1476141 n.2484A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrl 1476225 n.2568T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrl 1476227 n.2570C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrl 1476229 n.2572C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrl 1476250 n.2593C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476251 n.2594T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476257 n.2600G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476260 n.2603A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476280 n.2623A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1476293 n.2636C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476294 n.2637A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476295 n.2638C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476296 n.2639C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476297 n.2640C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476301 n.2644A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1476302 n.2645G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476309 n.2652G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrl 1476311 n.2654G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1476312 n.2655T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.24
rrl 1476313 n.2656G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.22
rrl 1476332 n.2675G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.19
rrl 1476337 n.2680C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1476338 n.2681C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrl 1476353 n.2696G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrl 1476358 n.2701T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.2
rrl 1476359 n.2702C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1476369 n.2712C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrl 1476372 n.2715T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.19
rrl 1476381 n.2724G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1476382 n.2725A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.18
rrl 1476383 n.2726T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.17
rrl 1476425 n.2768G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.16
rrl 1476428 n.2771C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrl 1476429 n.2772A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1476466 n.2809C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1476481 n.2824T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.7
rrl 1476506 n.2849T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.63
rrl 1476514 n.2857C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.14
rrl 1476515 n.2858C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1476519 n.2862C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rrl 1476524 n.2867C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476525 n.2868A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.49
rrl 1476528 n.2871A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1476530 n.2873C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476536 n.2879G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476539 n.2882A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476540 n.2883C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476547 n.2890C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rpsA 1834177 c.636A>C synonymous_variant 1.0
tlyA 1917972 c.33A>G synonymous_variant 1.0
katG 2154724 p.Arg463Leu missense_variant 1.0
PPE35 2167926 p.Leu896Ser missense_variant 1.0
Rv1979c 2223293 c.-129A>G upstream_gene_variant 1.0
eis 2714846 p.Val163Ile missense_variant 1.0
ald 3086788 c.-32T>C upstream_gene_variant 1.0
fprA 3473996 c.-11_-10insA upstream_gene_variant 1.0
Rv3236c 3612813 p.Thr102Ala missense_variant 1.0
embA 4242643 c.-590C>T upstream_gene_variant 1.0
embA 4243460 c.228C>T synonymous_variant 1.0
embB 4246584 p.Arg24Pro missense_variant 0.26
embB 4248115 c.1602C>T synonymous_variant 1.0
aftB 4267379 c.1458G>A synonymous_variant 1.0
aftB 4267647 p.Asp397Gly missense_variant 1.0
whiB6 4338595 c.-75delG upstream_gene_variant 1.0
gid 4407588 c.615A>G synonymous_variant 1.0
gid 4407927 p.Glu92Asp missense_variant 1.0