Run ID: ERR10796560
Sample name:
Date: 31-03-2023 11:11:29
Number of reads: 437543
Percentage reads mapped: 99.99
Strain: lineage4.9;lineage4.1
Drug-resistance: MDR-TB
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
lineage4.1 | Euro-American | T;X;H | None | 0.06 |
lineage4.9 | Euro-American (H37Rv-like) | T1 | None | 0.98 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
rpoB | 761114 | c.1312_1314delAAC | conservative_inframe_deletion | 0.4 | rifampicin |
rrs | 1472644 | n.799C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 | streptomycin |
rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 | streptomycin |
rrs | 1473247 | n.1402C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 | kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin |
rrs | 1473329 | n.1484G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 | kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin |
katG | 2155228 | p.Gln295Pro | missense_variant | 1.0 | isoniazid |
ahpC | 2726112 | c.-81C>T | upstream_gene_variant | 0.67 | isoniazid |
ahpC | 2726145 | c.-48G>A | upstream_gene_variant | 0.5 | isoniazid |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrB | 5769 | p.Pro177Leu | missense_variant | 0.67 |
gyrB | 6582 | p.Thr448Arg | missense_variant | 0.4 |
rpoB | 760353 | p.Glu183Lys | missense_variant | 0.67 |
rpoB | 762879 | p.Met1025Leu | missense_variant | 0.75 |
rpoC | 762911 | c.-459C>T | upstream_gene_variant | 0.77 |
rpoC | 762917 | c.-453C>T | upstream_gene_variant | 0.77 |
rpoC | 762920 | c.-450C>T | upstream_gene_variant | 0.91 |
rpoC | 762929 | c.-441G>T | upstream_gene_variant | 0.91 |
rpoC | 762932 | c.-438G>T | upstream_gene_variant | 0.77 |
rpoC | 762944 | c.-426C>T | upstream_gene_variant | 0.77 |
rpoC | 762956 | c.-414G>C | upstream_gene_variant | 0.82 |
rpoC | 762962 | c.-408C>T | upstream_gene_variant | 0.88 |
rpoC | 762971 | c.-399G>T | upstream_gene_variant | 0.83 |
rpoC | 762989 | c.-381G>C | upstream_gene_variant | 1.0 |
rpoC | 762992 | c.-378C>T | upstream_gene_variant | 0.67 |
rpoC | 765150 | p.Gly594Glu | missense_variant | 1.0 |
mmpL5 | 775639 | p.Ile948Val | missense_variant | 1.0 |
fbiC | 1305238 | p.His770Asn | missense_variant | 1.0 |
rrs | 1471659 | n.-187C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
rrs | 1471843 | n.-2_1delGGT | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1471850 | n.5G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1471851 | n.6T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrs | 1471923 | n.78T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1471925 | n.80T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrs | 1471927 | n.82T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrs | 1471928 | n.83T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrs | 1471936 | n.91A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrs | 1471996 | n.151C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1472078 | n.233C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrs | 1472080 | n.235G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1472102 | n.257G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.87 |
rrs | 1472106 | n.261G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrs | 1472112 | n.267C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrs | 1472113 | n.268T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrs | 1472150 | n.305T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1472172 | n.327T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1472251 | n.406G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1472282 | n.437T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrs | 1472333 | n.488G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrs | 1472338 | n.493A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrs | 1472344 | n.499C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrs | 1472379 | n.534T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1472400 | n.555C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1472416 | n.571C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrs | 1472422 | n.577T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrs | 1472476 | n.631A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1472494 | n.649A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1472496 | n.651T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1472498 | n.653C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1472507 | n.662C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrs | 1472517 | n.672T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472518 | n.673G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472530 | n.685G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1472537 | n.692C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1472544 | n.699C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.35 |
rrs | 1472545 | n.700A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.35 |
rrs | 1472558 | n.713G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrs | 1472566 | n.721G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrs | 1472569 | n.724G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrs | 1472571 | n.726G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.41 |
rrs | 1472579 | n.734G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.35 |
rrs | 1472581 | n.736A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1472597 | n.752G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrs | 1472598 | n.753A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrs | 1472599 | n.754G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472607 | n.762G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472616 | n.771G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrs | 1472655 | n.810G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1472660 | n.815T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrs | 1472661 | n.816A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472673 | n.828T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1472674 | n.829T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrs | 1472675 | n.830T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1472677 | n.832C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1472692 | n.847T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1472697 | n.852T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrs | 1472713 | n.868T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrs | 1472714 | n.869A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472716 | n.871C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrs | 1472742 | n.897C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrs | 1472744 | n.899A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrs | 1472755 | n.910G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrs | 1472781 | n.936C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrs | 1472790 | n.945T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.17 |
rrs | 1472793 | n.948A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrs | 1472803 | n.958T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrs | 1472824 | n.979T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrs | 1472827 | n.982G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrs | 1472828 | n.983T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrs | 1472840 | n.995A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrs | 1472841 | n.996G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrs | 1472846 | n.1001C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrs | 1472850 | n.1005T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472866 | n.1023dupT | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrs | 1472873 | n.1028C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrs | 1472874 | n.1029C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrs | 1472875 | n.1030T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrs | 1472880 | n.1035G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472895 | n.1050C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1472952 | n.1107T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.72 |
rrs | 1472955 | n.1110C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 |
rrs | 1472956 | n.1111T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrs | 1472957 | n.1112C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrs | 1472973 | n.1128A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1472987 | n.1142G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrs | 1472989 | n.1144G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrs | 1472990 | n.1145A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrs | 1473035 | n.1190G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1473055 | n.1210C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473056 | n.1211A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1473066 | n.1221A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1473088 | n.1243A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrs | 1473093 | n.1248C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473100 | n.1255G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrs | 1473102 | n.1257C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473104 | n.1259C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1473110 | n.1265T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrs | 1473111 | n.1266A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1473115 | n.1270G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrs | 1473121 | n.1276T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrs | 1473145 | n.1300C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1473166 | n.1321G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473252 | n.1407T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473259 | n.1414C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1473270 | n.1425G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1473276 | n.1431A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrs | 1473301 | n.1456T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrs | 1473305 | n.1460G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1473316 | n.1471C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrl | 1473392 | n.-266C>A | upstream_gene_variant | 0.89 |
rrl | 1474124 | n.467G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1474125 | n.468C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1474130 | n.473C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1474140 | n.483C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1474141 | n.484G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrl | 1474142 | n.485C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474151 | n.494C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474155 | n.498G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.77 |
rrl | 1474164 | n.507C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1474171 | n.514C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrl | 1474186 | n.529A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1474197 | n.540C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1474199 | n.542G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474202 | n.545T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrl | 1474249 | n.592G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474269 | n.612C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1474275 | n.618T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474280 | n.623C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1474281 | n.624A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474348 | n.691C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474351 | n.694G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474353 | n.696A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474354 | n.697C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474362 | n.705A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474444 | n.787G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474448 | n.791T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1474454 | n.797G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrl | 1474467 | n.810A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrl | 1474476 | n.819C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1474488 | n.831G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1474496 | n.839C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1474497 | n.840G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1474506 | n.849C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1474507 | n.850G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrl | 1474516 | n.859C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1474529 | n.872A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1474530 | n.873G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1474537 | n.880G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474539 | n.882C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrl | 1474540 | n.883T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1474558 | n.901G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474584 | n.927C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrl | 1474627 | n.970G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1474632 | n.975G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1474636 | n.979A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrl | 1474637 | n.980C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrl | 1474638 | n.981C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrl | 1474639 | n.982G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.87 |
rrl | 1474672 | n.1015C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1474676 | n.1019T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474677 | n.1020A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1474694 | n.1037C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrl | 1474734 | n.1077G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1474734 | n.1077G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1474749 | n.1092C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrl | 1474760 | n.1103A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1474777 | n.1120T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrl | 1474779 | n.1122G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrl | 1474782 | n.1125G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrl | 1474783 | n.1126G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.49 |
rrl | 1474794 | n.1137C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1474823 | n.1166C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.87 |
rrl | 1474827 | n.1170C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 |
rrl | 1474830 | n.1173A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1474830 | n.1173A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1474831 | n.1174A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1474864 | n.1207C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1474883 | n.1226T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrl | 1474904 | n.1247G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1474932 | n.1275C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1474945 | n.1288C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.35 |
rrl | 1475104 | n.1447T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1475114 | n.1457C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1475124 | n.1467A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1475137 | n.1480A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1475171 | n.1514C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 |
rrl | 1475202 | n.1545G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1475213 | n.1556C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1475649 | n.1992A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475655 | n.1998T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475657 | n.2000A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475659 | n.2002G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475672 | n.2015C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 |
rrl | 1475673 | n.2016T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrl | 1475699 | n.2042C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrl | 1475722 | n.2065G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrl | 1475751 | n.2094C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrl | 1475752 | n.2095C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrl | 1475753 | n.2096C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1475758 | n.2101A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1475761 | n.2104C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrl | 1475762 | n.2105G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1475763 | n.2106C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475764 | n.2107A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1475765 | n.2108A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrl | 1475766 | n.2109G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1475769 | n.2112T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrl | 1475775 | n.2118G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1475803 | n.2146T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1475804 | n.2147G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1475816 | n.2159C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1475817 | n.2160A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1475869 | n.2212C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1475881 | n.2224T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1475883 | n.2226A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrl | 1475898 | n.2241A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475899 | n.2242G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475916 | n.2259C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrl | 1475937 | n.2280A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475943 | n.2286G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1475952 | n.2295A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1475963 | n.2306G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.72 |
rrl | 1475970 | n.2313C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475975 | n.2318C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1475977 | n.2320A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1475978 | n.2321C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1475988 | n.2331A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1475993 | n.2336C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrl | 1475997 | n.2340A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1475998 | n.2341C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1476001 | n.2344T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1476030 | n.2373A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1476110 | n.2453G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1476115 | n.2458T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1476130 | n.2473G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrl | 1476131 | n.2474C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrl | 1476164 | n.2507A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1476194 | n.2537A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1476200 | n.2543A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1476201 | n.2544C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1476214 | n.2557G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1476215 | n.2558C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1476224 | n.2567A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1476245 | n.2588C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1476252 | n.2595T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1476253 | n.2596A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1476256 | n.2599A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1476260 | n.2603A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1476280 | n.2623A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrl | 1476281 | n.2624T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 |
rrl | 1476293 | n.2636C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrl | 1476294 | n.2637A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.86 |
rrl | 1476295 | n.2638C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1476296 | n.2639C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1476297 | n.2640C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1476311 | n.2654G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1476312 | n.2655T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrl | 1476313 | n.2656G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.49 |
rrl | 1476332 | n.2675G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1476338 | n.2681C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 |
rrl | 1476353 | n.2696G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1476357 | n.2700T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrl | 1476358 | n.2701T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrl | 1476368 | n.2711T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1476369 | n.2712C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrl | 1476372 | n.2715T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1476382 | n.2725A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrl | 1476383 | n.2726T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 |
rrl | 1476411 | n.2754G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476425 | n.2768G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrl | 1476428 | n.2771C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrl | 1476428 | n.2771C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1476429 | n.2772A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrl | 1476463 | n.2806C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrl | 1476481 | n.2824T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1476506 | n.2849T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1476514 | n.2857C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.49 |
rrl | 1476515 | n.2858C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.49 |
rrl | 1476519 | n.2862C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrl | 1476524 | n.2867C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1476524 | n.2867C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1476525 | n.2868A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1476530 | n.2873C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.87 |
rrl | 1476536 | n.2879G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1476538 | n.2881A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 |
rrl | 1476539 | n.2882A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.72 |
rrl | 1476540 | n.2883C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrl | 1476547 | n.2890C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 |
rrl | 1476567 | n.2910C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.34 |
rrl | 1476577 | n.2920T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1476583 | n.2926G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1476584 | n.2927C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1476585 | n.2928A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrl | 1476595 | n.2938C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476600 | n.2943A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476607 | n.2950C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1476608 | n.2951C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rpsA | 1833727 | c.186G>C | synonymous_variant | 0.4 |
rpsA | 1833732 | p.Pro64Leu | missense_variant | 0.4 |
rpsA | 1833736 | c.195C>T | synonymous_variant | 0.4 |
rpsA | 1833742 | c.201A>G | synonymous_variant | 0.4 |
rpsA | 1833770 | p.Asn77Asp | missense_variant | 0.4 |
rpsA | 1833776 | p.Val79Ile | missense_variant | 0.4 |
rpsA | 1834654 | c.1113G>A | synonymous_variant | 1.0 |
rpsA | 1834666 | c.1125G>C | synonymous_variant | 0.67 |
rpsA | 1834667 | p.Ala376Ser | missense_variant | 0.67 |
rpsA | 1834688 | c.1147_1149delAGTinsTCC | synonymous_variant | 0.67 |
tlyA | 1917972 | c.33A>G | synonymous_variant | 1.0 |
katG | 2156299 | c.-188G>T | upstream_gene_variant | 0.33 |
Rv1979c | 2221737 | p.Asp476Glu | missense_variant | 0.67 |
kasA | 2518076 | c.-39C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
folC | 2746331 | p.Glu423Val | missense_variant | 0.67 |
Rv2752c | 3066299 | c.-108C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
embA | 4244066 | c.834G>C | synonymous_variant | 0.4 |
embA | 4244993 | c.1761C>G | synonymous_variant | 1.0 |
whiB6 | 4338595 | c.-75delG | upstream_gene_variant | 1.0 |