TB-Profiler result

Run: ERR10796577
Summary

Run ID: ERR10796577

Sample name:

Date: 31-03-2023 11:11:51

Number of reads: 83067

Percentage reads mapped: 99.64

Strain: lineage4.9

Drug-resistance: RR-TB

Download CSV Download TXT Download PDF Download JSON
Drug resistance: This table reports drug-resistance associated mutations found in known resistance genes
Drug Resistance Supporting mutations
Lineage Table: The lineage is inferred by analysing lineage specific SNPs
Lineage Family Main Spoligotype RDs Frequency
lineage4 Euro-American LAM;T;S;X;H None 1.0
lineage4.9 Euro-American (H37Rv-like) T1 None 1.0
Drug resistance-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction Drugs
rpoB 761127 p.Ser441Ala missense_variant 1.0 rifampicin
rrs 1472644 n.799C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.51 streptomycin
rrs 1473247 n.1402C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.55 kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin
rrs 1473329 n.1484G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.42 kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin
Non-Associated Mutations: This table reports mutations found in candidate resistance genes which have not been associated with drug resistance
Gene Chromosome position Mutation Type Estimated fraction
rpoB 761088 c.1282_1283delAGinsTC synonymous_variant 1.0
rpoB 761096 c.1290G>C synonymous_variant 1.0
rpoB 761102 c.1296A>G synonymous_variant 1.0
rpoB 761132 c.1326G>C synonymous_variant 1.0
rpoB 761133 c.1327T>C synonymous_variant 1.0
rpoC 762854 c.-516G>C upstream_gene_variant 1.0
rpoB 762855 p.Val1017Ile missense_variant 1.0
rpoB 762858 p.Thr1018Ser missense_variant 1.0
rpoC 762863 c.-507T>G upstream_gene_variant 1.0
rpoB 762879 p.Met1025Leu missense_variant 1.0
rpoC 762887 c.-483G>C upstream_gene_variant 1.0
rpoC 762896 c.-474G>C upstream_gene_variant 0.5
rpoC 762920 c.-450C>T upstream_gene_variant 0.5
rpoC 762926 c.-444C>G upstream_gene_variant 0.5
rpoC 762929 c.-441G>T upstream_gene_variant 1.0
rpoC 762932 c.-438G>T upstream_gene_variant 0.5
rpoC 762938 c.-432G>C upstream_gene_variant 1.0
rpoC 762944 c.-426C>T upstream_gene_variant 1.0
rpoC 762962 c.-408C>T upstream_gene_variant 1.0
rpoC 762971 c.-399G>C upstream_gene_variant 1.0
rpoC 762983 c.-387C>T upstream_gene_variant 1.0
rpoC 762989 c.-381G>C upstream_gene_variant 1.0
rpoC 762995 c.-375G>T upstream_gene_variant 1.0
rrs 1471853 n.8T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1471896 n.51T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1471900 n.55C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrs 1472068 n.223T>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1472075 n.230A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.94
rrs 1472078 n.233C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1472102 n.257G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472106 n.261G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.52
rrs 1472108 n.263C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472112 n.267C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.52
rrs 1472113 n.268T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472122 n.277G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrs 1472123 n.278A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.37
rrs 1472124 n.279C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrs 1472150 n.305T>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1472155 n.310C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrs 1472160 n.315C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrs 1472172 n.327T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrs 1472225 n.380C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.31
rrs 1472251 n.406G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1472258 n.413A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrs 1472259 n.414C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.34
rrs 1472282 n.437T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.42
rrs 1472285 n.440A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1472324 n.479G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1472325 n.480G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1472328 n.483G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrs 1472338 n.493A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472344 n.499C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.95
rrs 1472379 n.534T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrs 1472400 n.555C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.92
rrs 1472412 n.567A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrs 1472416 n.571C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.77
rrs 1472422 n.577T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrs 1472462 n.617T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472464 n.619A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472473 n.628G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472474 n.629C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472476 n.631A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.89
rrs 1472494 n.649A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrs 1472496 n.651T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrs 1472498 n.653C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.96
rrs 1472513 n.668T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.98
rrs 1472549 n.704G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.96
rrs 1472558 n.713G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.42
rrs 1472569 n.724G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrs 1472581 n.736A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrs 1472581 n.736A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrs 1472584 n.739A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrs 1472597 n.752G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrs 1472607 n.762G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.46
rrs 1472647 n.802C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.39
rrs 1472655 n.810G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.98
rrs 1472660 n.815T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.96
rrs 1472690 n.845C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.31
rrs 1472692 n.847T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.9
rrs 1472707 n.862A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrs 1472714 n.869A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.89
rrs 1472755 n.910G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrs 1472790 n.945T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472824 n.979T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.91
rrs 1472825 n.980G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrs 1472828 n.983T>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1472840 n.995A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.77
rrs 1472875 n.1030T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrs 1472895 n.1050C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrs 1472952 n.1107T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrs 1472954 n.1109T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rrs 1472955 n.1110C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrs 1472956 n.1111T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrs 1472957 n.1112C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.94
rrs 1472973 n.1128A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrs 1472973 n.1128A>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1472987 n.1142G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rrs 1472989 n.1144G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrs 1472990 n.1145A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrs 1472992 n.1147A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrs 1473005 n.1160C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.41
rrs 1473035 n.1190G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrs 1473055 n.1210C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.98
rrs 1473056 n.1211A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrs 1473066 n.1221A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrs 1473088 n.1243A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1473093 n.1248C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.9
rrs 1473100 n.1255G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1473102 n.1257C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.89
rrs 1473104 n.1259C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1473110 n.1265T>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1473111 n.1266A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1473115 n.1270G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.66
rrs 1473121 n.1276T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrs 1473145 n.1300C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.93
rrs 1473166 n.1321G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.94
rrs 1473172 n.1327T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.28
rrs 1473173 n.1328C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.32
rrs 1473221 n.1376C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrs 1473252 n.1407T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.95
rrs 1473259 n.1414C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.96
rrs 1473270 n.1425G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.52
rrs 1473276 n.1431A>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1473276 n.1431A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrs 1473277 n.1432G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrs 1473293 n.1449delA non_coding_transcript_exon_variant 0.42
rrs 1473300 n.1455C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.49
rrs 1473301 n.1456T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrs 1473301 n.1456T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrs 1473305 n.1460G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrs 1473316 n.1471C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrl 1473384 n.-274A>G upstream_gene_variant 0.52
rrl 1473390 n.-268A>C upstream_gene_variant 0.25
rrl 1474124 n.467G>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474125 n.468C>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474130 n.473C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474140 n.483C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474141 n.484G>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474142 n.485C>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474151 n.494C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474155 n.498G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474163 n.506C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1474164 n.507C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474171 n.514C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.27
rrl 1474181 n.524C>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474184 n.527C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474185 n.528G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.32
rrl 1474186 n.529A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrl 1474197 n.540C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.96
rrl 1474199 n.542G>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474200 n.545delT non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474249 n.592G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474271 n.614A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrl 1474272 n.615C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrl 1474275 n.618T>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474348 n.691C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474351 n.694G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474353 n.696A>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474354 n.697C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474362 n.705A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474383 n.726G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrl 1474387 n.730C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474444 n.787G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1474448 n.791T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrl 1474454 n.797G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.55
rrl 1474467 n.810A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.81
rrl 1474476 n.819C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.28
rrl 1474483 n.826C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.32
rrl 1474488 n.831G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474495 n.838G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.68
rrl 1474496 n.839C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1474497 n.840G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrl 1474506 n.849C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrl 1474507 n.850G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1474508 n.851C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.68
rrl 1474516 n.859C>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474527 n.870T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.54
rrl 1474528 n.871T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrl 1474529 n.872A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.69
rrl 1474529 n.872A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.62
rrl 1474530 n.873G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1474537 n.880G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrl 1474539 n.882C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.41
rrl 1474540 n.883T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrl 1474540 n.883T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1474542 n.885A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1474551 n.894G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrl 1474558 n.901G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.31
rrl 1474626 n.969T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.52
rrl 1474632 n.975G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrl 1474634 n.977T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.64
rrl 1474677 n.1020A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474709 n.1052G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1474734 n.1077G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.98
rrl 1474749 n.1092C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.73
rrl 1474753 n.1097delC non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474760 n.1103A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474779 n.1122G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.71
rrl 1474780 n.1123C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.66
rrl 1474782 n.1125G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrl 1474794 n.1137C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrl 1474802 n.1145T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1474823 n.1166C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.82
rrl 1474830 n.1173A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrl 1474831 n.1174A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1474832 n.1175A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1474864 n.1207C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1474883 n.1226T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.34
rrl 1474901 n.1244A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrl 1474904 n.1247G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.89
rrl 1474913 n.1256T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.56
rrl 1474932 n.1275C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1474933 n.1276A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.4
rrl 1474934 n.1277C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.38
rrl 1474946 n.1289C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.69
rrl 1474948 n.1291C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.86
rrl 1475137 n.1480A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1475171 n.1514C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475649 n.1992A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475655 n.1998T>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475659 n.2002G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475672 n.2015C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1475673 n.2016T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1475686 n.2029C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrl 1475696 n.2039T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1475699 n.2042C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475703 n.2046A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.49
rrl 1475715 n.2058G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.42
rrl 1475722 n.2065G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.42
rrl 1475751 n.2094C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.98
rrl 1475751 n.2094C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.98
rrl 1475752 n.2095C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.42
rrl 1475753 n.2096C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.51
rrl 1475756 n.2099T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1475769 n.2112T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.43
rrl 1475775 n.2118G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrl 1475777 n.2120A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.55
rrl 1475869 n.2212C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.34
rrl 1475881 n.2224T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.44
rrl 1475883 n.2226A>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475883 n.2226A>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475884 n.2227A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.63
rrl 1475892 n.2235A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.46
rrl 1475896 n.2239A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.49
rrl 1475897 n.2240T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrl 1475898 n.2241A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475899 n.2242G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475906 n.2249C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.39
rrl 1475916 n.2259C>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475937 n.2280A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.95
rrl 1475943 n.2286G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475945 n.2288C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.66
rrl 1475952 n.2295A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.94
rrl 1475963 n.2306G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.35
rrl 1475970 n.2313C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475975 n.2318C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrl 1475977 n.2320A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrl 1475978 n.2321C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.37
rrl 1475988 n.2331A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475993 n.2336C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.75
rrl 1475997 n.2340A>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1475998 n.2341C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.88
rrl 1476001 n.2344T>C non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476030 n.2373A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476032 n.2375C>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476034 n.2377C>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476040 n.2383C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476045 n.2388G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476047 n.2390G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476049 n.2392C>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476110 n.2453G>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476115 n.2458T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.89
rrl 1476116 n.2459A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.27
rrl 1476130 n.2473G>A non_coding_transcript_exon_variant 0.72
rrl 1476131 n.2474C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.92
rrl 1476164 n.2507A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.71
rrl 1476194 n.2537A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.99
rrl 1476200 n.2543A>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476201 n.2544C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrl 1476214 n.2557G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.78
rrl 1476215 n.2558C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.8
rrl 1476224 n.2567A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.98
rrl 1476245 n.2588C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.91
rrl 1476252 n.2595T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrl 1476253 n.2596A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.9
rrl 1476256 n.2599A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.94
rrl 1476260 n.2603A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476281 n.2624T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.77
rrl 1476293 n.2636C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrl 1476294 n.2637A>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476295 n.2638C>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476296 n.2639C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrl 1476297 n.2640C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.95
rrl 1476299 n.2642C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1476300 n.2643G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.57
rrl 1476301 n.2644A>T non_coding_transcript_exon_variant 0.58
rrl 1476308 n.2651G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.59
rrl 1476311 n.2654G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.94
rrl 1476312 n.2655T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.97
rrl 1476332 n.2675G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.3
rrl 1476338 n.2681C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.32
rrl 1476358 n.2701T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.47
rrl 1476359 n.2702C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.52
rrl 1476369 n.2712C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476372 n.2715T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.28
rrl 1476381 n.2724G>C non_coding_transcript_exon_variant 0.45
rrl 1476382 n.2725A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.51
rrl 1476383 n.2726T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1476428 n.2771C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.9
rrl 1476429 n.2772A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.6
rrl 1476466 n.2809C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.61
rrl 1476481 n.2824T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.96
rrl 1476506 n.2849T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.85
rrl 1476513 n.2856G>T non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1476515 n.2858C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.74
rrl 1476519 n.2862C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.24
rrl 1476523 n.2866T>C non_coding_transcript_exon_variant 0.29
rrl 1476524 n.2867C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.95
rrl 1476525 n.2868A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.95
rrl 1476530 n.2873C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.81
rrl 1476536 n.2879G>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476547 n.2890C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.54
rrl 1476567 n.2910C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.48
rrl 1476584 n.2927C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.98
rrl 1476585 n.2928A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.87
rrl 1476594 n.2937C>A non_coding_transcript_exon_variant 0.65
rrl 1476600 n.2943A>C non_coding_transcript_exon_variant 0.31
rrl 1476608 n.2951C>G non_coding_transcript_exon_variant 0.89
rrl 1476614 n.2957A>T non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476616 n.2959A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1476619 n.2962C>T non_coding_transcript_exon_variant 0.83
rrl 1476628 n.2971T>G non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476629 n.2972C>A non_coding_transcript_exon_variant 1.0
rrl 1476630 n.2973A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.33
rrl 1476633 n.2976A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rrl 1476661 n.3004A>G non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476664 n.3007T>A non_coding_transcript_exon_variant 0.5
rrl 1476665 n.3008T>G non_coding_transcript_exon_variant 0.67
rpsA 1834189 c.648G>T synonymous_variant 1.0
rpsA 1834195 c.654G>C synonymous_variant 1.0
rpsA 1834228 c.687C>T synonymous_variant 0.67
rpsA 1834234 c.693G>C synonymous_variant 1.0
rpsA 1834240 c.699T>C synonymous_variant 1.0
rpsA 1834241 c.700C>T synonymous_variant 0.67
rpsA 1834246 c.705G>T synonymous_variant 0.67
rpsA 1834249 c.708T>C synonymous_variant 1.0
rpsA 1834261 c.720A>G synonymous_variant 1.0
rpsA 1834264 c.723G>C synonymous_variant 1.0
whiB7 3568583 p.Pro33Ser missense_variant 1.0