Run ID: ERR10796634
Sample name:
Date: 31-03-2023 11:12:56
Number of reads: 543829
Percentage reads mapped: 99.99
Strain: lineage4
Drug-resistance: Other
Drug | Resistance | Supporting mutations |
---|
Lineage | Family | Main Spoligotype | RDs | Frequency |
---|---|---|---|---|
lineage4 | Euro-American | LAM;T;S;X;H | None | 1.0 |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction | Drugs |
---|---|---|---|---|---|
rrs | 1472644 | n.799C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 | streptomycin |
rrs | 1472733 | n.888G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 | streptomycin |
rrs | 1473247 | n.1402C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 | kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin |
rrs | 1473329 | n.1484G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 | kanamycin, capreomycin, aminoglycosides, amikacin |
Gene | Chromosome position | Mutation | Type | Estimated fraction |
---|---|---|---|---|
gyrB | 6131 | p.Ser298Pro | missense_variant | 0.15 |
gyrA | 7362 | p.Glu21Gln | missense_variant | 1.0 |
ccsA | 620770 | p.Trp294Gly | missense_variant | 1.0 |
rpoB | 762042 | p.Ile746Val | missense_variant | 0.18 |
rpoB | 762879 | p.Met1025Leu | missense_variant | 0.5 |
rpoC | 762887 | c.-483G>C | upstream_gene_variant | 0.29 |
rpoC | 762911 | c.-459C>T | upstream_gene_variant | 0.25 |
rpoC | 762917 | c.-453C>T | upstream_gene_variant | 0.25 |
rpoC | 762920 | c.-450C>T | upstream_gene_variant | 0.5 |
rpoC | 762929 | c.-441G>T | upstream_gene_variant | 0.57 |
rpoC | 762932 | c.-438G>T | upstream_gene_variant | 0.57 |
rpoC | 762938 | c.-432G>C | upstream_gene_variant | 0.33 |
rpoC | 762944 | c.-426C>T | upstream_gene_variant | 0.67 |
rpoC | 762957 | c.-413C>T | upstream_gene_variant | 0.29 |
rpoC | 762962 | c.-408C>T | upstream_gene_variant | 0.33 |
rpoC | 762971 | c.-399G>C | upstream_gene_variant | 0.5 |
rpoC | 762974 | c.-396G>A | upstream_gene_variant | 0.33 |
rpoC | 762983 | c.-387C>T | upstream_gene_variant | 0.67 |
rpoC | 762989 | c.-381G>C | upstream_gene_variant | 0.67 |
rpoC | 762995 | c.-375G>T | upstream_gene_variant | 0.5 |
rpoC | 764876 | p.Thr503Ala | missense_variant | 0.25 |
rpoC | 766499 | p.Ala1044Thr | missense_variant | 0.25 |
mmpL5 | 775639 | p.Ile948Val | missense_variant | 1.0 |
rpsL | 781395 | c.-165T>C | upstream_gene_variant | 1.0 |
rplC | 800646 | c.-163T>G | upstream_gene_variant | 0.4 |
embR | 1416681 | p.Asp223Asn | missense_variant | 0.25 |
rrs | 1471659 | n.-187C>T | upstream_gene_variant | 1.0 |
rrs | 1471896 | n.51T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrs | 1471900 | n.55C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1471922 | n.78delT | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1471925 | n.81_82insCAGC | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1471935 | n.90T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1471936 | n.91A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1471969 | n.124T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrs | 1471970 | n.125G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrs | 1471984 | n.139T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1471985 | n.140T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrs | 1471986 | n.141C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1472068 | n.223T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrs | 1472075 | n.230A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrs | 1472078 | n.233C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrs | 1472102 | n.257G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrs | 1472106 | n.261G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472108 | n.263C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 |
rrs | 1472112 | n.267C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472113 | n.268T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrs | 1472122 | n.277G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrs | 1472123 | n.278A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrs | 1472124 | n.279C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrs | 1472141 | n.296G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1472148 | n.303T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.37 |
rrs | 1472150 | n.305T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1472151 | n.306C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrs | 1472155 | n.310C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrs | 1472160 | n.315C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrs | 1472172 | n.327T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.34 |
rrs | 1472251 | n.406G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrs | 1472251 | n.406G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1472258 | n.413A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrs | 1472259 | n.414C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrs | 1472279 | n.434T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472282 | n.437T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472284 | n.439C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrs | 1472285 | n.440A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1472286 | n.441C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472344 | n.499C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrs | 1472378 | n.533G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472379 | n.534T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.44 |
rrs | 1472380 | n.535G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472396 | n.551A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472400 | n.555C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrs | 1472412 | n.567A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrs | 1472476 | n.631A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 |
rrs | 1472484 | n.639A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472485 | n.640G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472489 | n.644A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrs | 1472494 | n.649A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrs | 1472496 | n.651T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrs | 1472498 | n.653C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.87 |
rrs | 1472507 | n.662C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.53 |
rrs | 1472513 | n.668T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrs | 1472517 | n.672T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrs | 1472518 | n.673G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrs | 1472530 | n.685G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.59 |
rrs | 1472537 | n.692C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrs | 1472544 | n.699C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.58 |
rrs | 1472545 | n.700A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrs | 1472549 | n.704G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472558 | n.713G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.26 |
rrs | 1472566 | n.721G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.59 |
rrs | 1472569 | n.724G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.26 |
rrs | 1472571 | n.726G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrs | 1472579 | n.734G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472580 | n.735C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrs | 1472581 | n.736A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.99 |
rrs | 1472584 | n.739A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrs | 1472597 | n.752G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1472598 | n.753A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrs | 1472599 | n.754G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrs | 1472607 | n.762G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1472616 | n.771G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrs | 1472655 | n.810G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrs | 1472655 | n.810G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrs | 1472658 | n.813G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.49 |
rrs | 1472660 | n.815T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrs | 1472661 | n.816A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.52 |
rrs | 1472670 | n.825G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.46 |
rrs | 1472690 | n.845C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrs | 1472692 | n.847T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrs | 1472697 | n.852T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrs | 1472713 | n.868T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrs | 1472714 | n.869A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrs | 1472716 | n.871C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.63 |
rrs | 1472742 | n.897C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrs | 1472744 | n.899A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrs | 1472781 | n.936C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrs | 1472790 | n.945T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrs | 1472793 | n.948A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.81 |
rrs | 1472803 | n.958T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrs | 1472824 | n.979T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1472827 | n.982G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrs | 1472828 | n.983T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1472840 | n.995A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrs | 1472875 | n.1030T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrs | 1472895 | n.1050C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1472952 | n.1107T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrs | 1472954 | n.1109T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472955 | n.1110C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrs | 1472956 | n.1111T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrs | 1472957 | n.1112C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrs | 1472958 | n.1113A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrs | 1472973 | n.1128A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1472973 | n.1128A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1472974 | n.1129A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrs | 1472987 | n.1142G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrs | 1472988 | n.1143T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1472989 | n.1144G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrs | 1472990 | n.1145A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrs | 1472992 | n.1147A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrs | 1473035 | n.1190G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473055 | n.1210C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrs | 1473056 | n.1211A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrs | 1473066 | n.1221A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1473088 | n.1243A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1473093 | n.1248C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrs | 1473100 | n.1255G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473102 | n.1257C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.83 |
rrs | 1473104 | n.1259C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1473110 | n.1265T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1473111 | n.1266A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrs | 1473115 | n.1270G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrs | 1473121 | n.1276T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1473123 | n.1278A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1473145 | n.1300C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrs | 1473166 | n.1321G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrs | 1473172 | n.1327T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrs | 1473173 | n.1328C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrs | 1473221 | n.1376C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.28 |
rrs | 1473252 | n.1407T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrs | 1473259 | n.1414C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrs | 1473270 | n.1425G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrs | 1473276 | n.1431A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrs | 1473276 | n.1431A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrs | 1473277 | n.1432G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrs | 1473301 | n.1456T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrs | 1473301 | n.1456T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrs | 1473305 | n.1460G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.28 |
rrs | 1473315 | n.1470T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.41 |
rrs | 1473316 | n.1471C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1473392 | n.-266C>A | upstream_gene_variant | 0.4 |
rrl | 1474124 | n.467G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474125 | n.468C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474130 | n.473C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474140 | n.483C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474141 | n.484G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474142 | n.485C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474151 | n.494C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474155 | n.498G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474164 | n.507C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1474171 | n.514C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1474181 | n.524C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474183 | n.526T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1474184 | n.527C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1474185 | n.528G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1474186 | n.529A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1474197 | n.540C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1474199 | n.542G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1474202 | n.545T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474218 | n.561T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1474228 | n.571T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1474249 | n.592G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrl | 1474269 | n.612C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrl | 1474275 | n.618T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 |
rrl | 1474280 | n.623C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1474294 | n.637C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 1.0 |
rrl | 1474447 | n.790G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1474448 | n.791T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.41 |
rrl | 1474454 | n.797G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1474467 | n.810A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1474476 | n.819C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1474488 | n.831G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.92 |
rrl | 1474495 | n.838G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1474496 | n.839C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1474497 | n.840G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1474498 | n.841G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.64 |
rrl | 1474505 | n.848C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 |
rrl | 1474506 | n.849C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1474507 | n.850G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1474508 | n.851C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.73 |
rrl | 1474516 | n.859C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.91 |
rrl | 1474527 | n.870T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.49 |
rrl | 1474529 | n.872A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrl | 1474530 | n.873G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1474537 | n.880G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1474539 | n.882C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1474540 | n.883T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.43 |
rrl | 1474542 | n.885A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.53 |
rrl | 1474558 | n.901G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrl | 1474584 | n.927C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1474626 | n.969T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrl | 1474627 | n.970G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1474632 | n.975G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrl | 1474634 | n.977T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1474636 | n.979A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1474636 | n.979A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrl | 1474637 | n.980C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrl | 1474637 | n.980C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrl | 1474638 | n.981C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.98 |
rrl | 1474639 | n.982G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrl | 1474640 | n.983C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.46 |
rrl | 1474643 | n.986A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrl | 1474658 | n.1001A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrl | 1474663 | n.1006C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.41 |
rrl | 1474672 | n.1015C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.34 |
rrl | 1474676 | n.1019T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.53 |
rrl | 1474677 | n.1020A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1474692 | n.1035G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrl | 1474706 | n.1049G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 |
rrl | 1474709 | n.1052G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrl | 1474734 | n.1077G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.9 |
rrl | 1474734 | n.1077G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474749 | n.1092C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrl | 1474753 | n.1097delC | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474760 | n.1103A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1474779 | n.1122G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrl | 1474780 | n.1123C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrl | 1474782 | n.1125G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrl | 1474794 | n.1137C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1474802 | n.1145T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrl | 1474823 | n.1166C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrl | 1474824 | n.1167A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.41 |
rrl | 1474827 | n.1170C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrl | 1474830 | n.1173A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1474830 | n.1173A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrl | 1474831 | n.1174A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1474831 | n.1174A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1474832 | n.1175A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrl | 1474864 | n.1207C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1474883 | n.1226T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrl | 1474901 | n.1244A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1474903 | n.1246T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrl | 1474904 | n.1247G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1474913 | n.1256T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrl | 1474932 | n.1275C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrl | 1474946 | n.1289C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1474948 | n.1291C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1474951 | n.1294C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1475090 | n.1433A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1475104 | n.1447T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1475659 | n.2002G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.35 |
rrl | 1475673 | n.2016T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1475686 | n.2029C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.56 |
rrl | 1475688 | n.2031G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrl | 1475692 | n.2035G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1475696 | n.2039T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrl | 1475699 | n.2042C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1475703 | n.2046A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.37 |
rrl | 1475706 | n.2049A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrl | 1475707 | n.2050T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.16 |
rrl | 1475713 | n.2056C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrl | 1475715 | n.2058G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1475722 | n.2065G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.26 |
rrl | 1475751 | n.2094C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1475752 | n.2095C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1475753 | n.2096C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1475769 | n.2112T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.22 |
rrl | 1475772 | n.2115A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.54 |
rrl | 1475775 | n.2118G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1475777 | n.2120A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.72 |
rrl | 1475869 | n.2212C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1475881 | n.2224T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1475883 | n.2226A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1475883 | n.2226A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1475884 | n.2227A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1475892 | n.2235A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrl | 1475897 | n.2240T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1475898 | n.2241A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.94 |
rrl | 1475899 | n.2242G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.93 |
rrl | 1475900 | n.2243A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.35 |
rrl | 1475906 | n.2249C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1475916 | n.2259C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1475937 | n.2280A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrl | 1475938 | n.2281C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.38 |
rrl | 1475943 | n.2286G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrl | 1475945 | n.2288C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.66 |
rrl | 1475952 | n.2295A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrl | 1475963 | n.2306G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1475970 | n.2313C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.84 |
rrl | 1475975 | n.2318C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.85 |
rrl | 1475977 | n.2320A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.7 |
rrl | 1475977 | n.2320A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1475988 | n.2331A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.72 |
rrl | 1475993 | n.2336C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1475997 | n.2340A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1475998 | n.2341C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1475999 | n.2342G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrl | 1476001 | n.2344T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.27 |
rrl | 1476030 | n.2373A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1476032 | n.2375C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rrl | 1476034 | n.2377C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 |
rrl | 1476035 | n.2378G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.36 |
rrl | 1476045 | n.2388G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1476049 | n.2392C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.4 |
rrl | 1476110 | n.2453G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476115 | n.2458T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.21 |
rrl | 1476126 | n.2469C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.28 |
rrl | 1476130 | n.2473G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrl | 1476131 | n.2474C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1476135 | n.2478T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.3 |
rrl | 1476141 | n.2484A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.33 |
rrl | 1476153 | n.2496T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.31 |
rrl | 1476164 | n.2507A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrl | 1476165 | n.2508T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.24 |
rrl | 1476194 | n.2537A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrl | 1476200 | n.2543A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1476201 | n.2544C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1476214 | n.2557G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.55 |
rrl | 1476215 | n.2558C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1476224 | n.2567A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.5 |
rrl | 1476245 | n.2588C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.45 |
rrl | 1476252 | n.2595T>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1476253 | n.2596A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476256 | n.2599A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.48 |
rrl | 1476260 | n.2603A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1476281 | n.2624T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.67 |
rrl | 1476294 | n.2637A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476295 | n.2638C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrl | 1476296 | n.2639C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.51 |
rrl | 1476297 | n.2640C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 |
rrl | 1476298 | n.2641C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.47 |
rrl | 1476300 | n.2643G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.57 |
rrl | 1476301 | n.2644A>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.61 |
rrl | 1476309 | n.2652G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.39 |
rrl | 1476311 | n.2654G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.62 |
rrl | 1476312 | n.2655T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.41 |
rrl | 1476313 | n.2656G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrl | 1476332 | n.2675G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1476338 | n.2681C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1476353 | n.2696G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.71 |
rrl | 1476358 | n.2701T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrl | 1476369 | n.2712C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.76 |
rrl | 1476372 | n.2715T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 |
rrl | 1476382 | n.2725A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.78 |
rrl | 1476383 | n.2726T>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.8 |
rrl | 1476425 | n.2768G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 |
rrl | 1476428 | n.2771C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.89 |
rrl | 1476429 | n.2772A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.79 |
rrl | 1476481 | n.2824T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.96 |
rrl | 1476506 | n.2849T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.88 |
rrl | 1476513 | n.2856G>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.2 |
rrl | 1476514 | n.2857C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrl | 1476515 | n.2858C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.32 |
rrl | 1476519 | n.2862C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1476524 | n.2867C>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1476524 | n.2867C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.97 |
rrl | 1476525 | n.2868A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.95 |
rrl | 1476530 | n.2873C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.6 |
rrl | 1476536 | n.2879G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.75 |
rrl | 1476538 | n.2881A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.65 |
rrl | 1476539 | n.2882A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.82 |
rrl | 1476540 | n.2883C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.69 |
rrl | 1476544 | n.2887T>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1476547 | n.2890C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.49 |
rrl | 1476567 | n.2910C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.25 |
rrl | 1476584 | n.2927C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.74 |
rrl | 1476585 | n.2928A>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.68 |
rrl | 1476592 | n.2935G>A | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1476596 | n.2939C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.42 |
rrl | 1476600 | n.2943A>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.19 |
rrl | 1476605 | n.2948C>T | non_coding_transcript_exon_variant | 0.18 |
rrl | 1476608 | n.2951C>G | non_coding_transcript_exon_variant | 0.23 |
rrl | 1476744 | n.3087G>C | non_coding_transcript_exon_variant | 0.29 |
rpsA | 1833724 | c.183C>G | synonymous_variant | 0.17 |
rpsA | 1833727 | c.186G>C | synonymous_variant | 0.17 |
rpsA | 1833742 | c.201A>G | synonymous_variant | 0.2 |
rpsA | 1833745 | c.204G>C | synonymous_variant | 0.2 |
rpsA | 1834117 | c.576G>A | synonymous_variant | 0.17 |
rpsA | 1834153 | c.612T>C | synonymous_variant | 0.15 |
rpsA | 1834154 | p.Asn205Gln | missense_variant | 0.15 |
rpsA | 1834157 | c.616T>C | synonymous_variant | 0.15 |
rpsA | 1834162 | c.621A>G | synonymous_variant | 0.15 |
rpsA | 1834177 | c.636A>C | synonymous_variant | 0.17 |
rpsA | 1834189 | c.648G>C | synonymous_variant | 0.17 |
rpsA | 1834195 | c.654G>C | synonymous_variant | 0.17 |
tlyA | 1917972 | c.33A>G | synonymous_variant | 1.0 |
ndh | 2101816 | c.1227C>T | synonymous_variant | 0.4 |
katG | 2155918 | p.Ala65Val | missense_variant | 0.33 |
Rv1979c | 2223013 | p.Tyr51Cys | missense_variant | 0.17 |
Rv1979c | 2223293 | c.-129A>G | upstream_gene_variant | 1.0 |
kasA | 2518020 | c.-95A>G | upstream_gene_variant | 0.33 |
kasA | 2519291 | p.Asp393Asn | missense_variant | 0.5 |
fbiD | 3339415 | p.Glu100Gln | missense_variant | 0.22 |
fprA | 3474331 | p.Asp109Asn | missense_variant | 0.2 |
whiB7 | 3568564 | p.Ala39Val | missense_variant | 0.29 |
fbiB | 3642858 | p.Ala442Thr | missense_variant | 0.4 |
rpoA | 3877682 | p.Val276Leu | missense_variant | 0.18 |
rpoA | 3878058 | c.450G>A | synonymous_variant | 0.25 |
clpC1 | 4040626 | p.Tyr27His | missense_variant | 0.14 |
embC | 4241519 | p.Arg553Cys | missense_variant | 0.33 |
embB | 4247463 | p.Ser317Phe | missense_variant | 0.25 |
embB | 4249732 | c.3219C>G | synonymous_variant | 1.0 |
aftB | 4267206 | c.1630dupG | frameshift_variant | 0.29 |
ethA | 4327475 | c.-2C>A | upstream_gene_variant | 0.67 |
whiB6 | 4338595 | c.-75delG | upstream_gene_variant | 1.0 |
gid | 4408275 | c.-73G>T | upstream_gene_variant | 0.25 |